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Programme: msh2her.pl » msh2her.pl

version 2.2 - Gérard Rio, 30/03/2016 12:00

 
#!/usr/bin/perl
use strict;

##############################################################################################
# script pour passer du format de maillage genere par gmsh au format lu par herezh++ #
# version 1: version initiale #
# version 1.1: 30 avr 2008 prise en compte du fait qu'il peut ne pas y avoir de reference #
# de type chaine de caractères #
# version 1.2: 9 mai 2008 Dans le cas où on ne conserve pas les éléments noeuds, on conserve#
# quand m^eme les références associées. Au niveau des tag on différencie entre #
# 1) les physical name (c'est-à-dire les ref que l'on met #
# 2) le numéro de l'entité géométrique élémentaires #
# 3) le numéro de la partition de maillage #
# version 1.3: 13 mai 2008 #
# 1) introduction de références d'aretes et de surfaces pour les #
# éléments lignes et surfaces (uniquement) #
# 2) construction de références de noeuds correspondants aux refs d'éléments #
# que ces éléments soient concervés ou non #
# version 1.4: 23 mai 2008 #
# correction d'un bug sur l'affichage du nombre total d'element #
# version 1.5: 6 fevrier 2009 #
# correction de la numérotation pour les éléments quadratiques #
# suppression blancs et tab en debut de ligne, en lecture du .msh #
# version 1.6: 13 avril 2010 - S. Bochard #
# maillage msh au format 2.1 depuis gmsh-2.4 #
# correction lecture references pour sorties générées par gmsh-2.4 #
# version 1.7: 5 fevrier 2011 #
# re-correction de la numérotation pour les éléments quadratiques #
# hexaedre incomplet, introduction du nombre de pti #
# version 1.8: 19 octobre 2011 - S. Bochard #
# maillage msh au format 2.2 depuis gmsh-2.5 #
# correction format maillage 2.1 et supérieur pour gmsh 2.4 et 2.5 #
# version 1.9: 1 fevrier 2012 - G. Rio #
# correction bug sur la sortie des tetraedres quadratiques #
# version 2.0: 10 decembre 2012 - G. Rio #
# correction bug sur la sortie des tetraedres quadratiques #
# version 2.1: 15 decembre 2012 - G. Rio #
# correction bug sur la sortie des tetraedres quadratiques #
# version 2.2: 2 decembre 2015 - G. Rio #
# ajout du nom du type d'élément, quand question nombre de pti #
##############################################################################################

my $nom;
my $version = "2.2";
if (@ARGV[0] eq '-h')
# si on n'a pas d'argument, on donne le mode d'emploi
{
print ("\n");
print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n" . '# #');
print ("\n" . '# msh2her.pl #');
print ("\n" . '# transformation d\'un maillage genere par le programme gmsh #');
print ("\n" . '# en un maillage utilisable par Herezh++ #');
print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n" . '# licence GPL, gerard.rio@univ-ubs.fr #');
print ("\n" . '# http://www-lg2m.univ-ubs.fr/~rio #');
print ("\n" . '# version '."$version".' #');
print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n\n\n");
print ("\n usage: msh2her.pl ");
print ("\n ----> entree interactive des noms de fichier \n");
print ("\n usage: msh2her.pl <nom fichier.msh> <nom fichier.her> \n");
print ("\n ----> indication de la source et de la cible ");
print ("\n NB: les noms de fichier peuvent avoir ou non leur extension \n");
print ("\n usage: msh2her.pl -v ");
print ("\n ----> affiche la version du programme \n");
print ("\n usage: msh2her.pl -h ");
print ("\n ----> information sur l'utilisation \n");
print ("\n\n");
die ("arret normal");
}
elsif (@ARGV[0] eq '-v')
{ print ("\n msh2her.pl: version "."$version"."\n\n");
die ("arret normal");
};

#------------------- écriture de l'entete à l'écran -----------------
print ("\n");
print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n" . '# #');
print ("\n" . '# msh2her.pl #');
print ("\n" . '# transformation d\'un maillage genere par le programme gmsh #');
print ("\n" . '# en un maillage utilisable par Herezh++ #');
print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n" . '# licence GPL, gerard.rio@univ-ubs.fr #');
print ("\n" . '# http://www-lg2m.univ-ubs.fr/~rio #');
print ("\n" . '# version '."$version".' #');
print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n\n\n");

#------------------- fin écriture de l'entete à l'écran -----------------

#------------------- on s'occupe tout d'abord des fichiers --------------------

# tout d'abord on récupère le nom du fichier à traiter
my $nombase;
if (@ARGV[0])
# si on a un argument, c'est le nom du fichier
{ $nombase = @ARGV[0];}
else
# sinon on demande interactivement le nom du fichier
{ print ("\n nom du fichier ? ");
$nombase = <STDIN>; chomp($nombase); # on supprime le retour à la ligne
};

# on supprime l'extension .msh si elle existe
$nombase =~ s/\.msh//;

# on ouvre le fichier msh en lecture tout d'abord, il doit donc exister
my $fichier_msh = $nombase . '.msh';
open (fic_msh,$fichier_msh) || die (" \n erreur en ouverture du fichier " . $fichier_msh . " \n");

# on ouvre le fichier .her en écriture, on écrase donc le fichier existant
my $fichier_her;
if (@ARGV[1])
# si on a un argument 2, c'est le nom du fichier de sortie
{ $fichier_her = @ARGV[1];}
else
# sinon on construit le nom du fichier
{$fichier_her = $nombase . '.her';
# on regarde s'il existe déjà
foreach (<*.her>)
{ if ($_ eq $fichier_her)
{ print ("\n le fichier " . $fichier_her . " existe deja ! ");
print ("\n voulez-vous l\' ecraser ? (0 ou N ) ");
my $rep = <STDIN>; chomp($rep); $rep=lc($rep); # lc passage en minuscule
if ($rep eq 'n')
{print ("\n nom du fichier de sortie ? ");
$fichier_her = <STDIN>; chomp($fichier_her);
};
};
}; # fin du foreach
};
# on supprime l'extension .her si elle existe
$fichier_her =~ s/\.her//;
# et on la rajoute
$fichier_her .= '.her';

# maintenant on tente l'ouverture de fichier
open (fic_her,">$fichier_her") || die (" \n erreur en ouverture du fichier " . $fichier_her . " \n");
#------------------------ fin des ouvertures de fichiers ---------------------


#------------------ lecture des tag qui vont servir pour fabriquer les références -------------
print ("\n lecture des tags (preparation a la creation des references) ");
# on lit dans les lignes jusqu'au mot clé $PhysicalNames
my $ligne;my @champ; my $existe_physicalNames = 0;
my $position_sur_node = 0; # pour signaler que l'on est à la position des noeuds
#
# debut des modifications - Stéphane
#
my $mesh_format; # ajout Stéphane
while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $PhysicalNames
if ( $champ[0] eq '$MeshFormat' ) # ajout Stéphane
{$ligne = <fic_msh>; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne suivante # ajout Stéphane
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne # ajout Stéphane
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces # ajout Stéphane
$mesh_format = $champ[0]; # on recupere le format du maillage # ajout Stéphane
print ("\n format de sauvegarde du maillage : msh " . $mesh_format . "\n" ); # ajout Stéphane
} # ajout Stéphane
if ( $champ[0] eq '$PhysicalNames' )
{$existe_physicalNames = 1;# on a trouvé le premier enreg,
last;
}
elsif ( $champ[0] eq '$Nodes' )
{$existe_physicalNames = 0;# on a pas trouvé de $PhysicalNames
print "\n **** NB: pas de chaine de caractere pour references a lire *****\n";
$position_sur_node = 1; # drapeau qui signale que l'on est au début des noeuds
last;
};
};


# --- on lit les tag si il en existe
my %les_references = () ; # déclaration de la table des reference
if ($existe_physicalNames)
{ $ligne = <fic_msh>; chomp($ligne);
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
print (" nombre total de references lus : " . $champ[0] );
my $nb_reference = $champ[0] ;

# --- on lit chaque ligne de reference que l'on recopie dans un tableau jusqu'au mot clé $EndPhysicalNames
while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $EndPhysicalNames
if ( $champ[0] eq '$EndPhysicalNames' )
{last;}; # on a trouvé le mot cle de fin de reference,
# ce n'est pas le mot clé, donc on enregistre la reference
if ($mesh_format eq "2") # ajout Stéphane
{$champ[1] =~ s/\"+//g; # on retire les guillemets éventuelles # ajout Stéphane
$les_references{"$champ[0]"}= "$champ[1]"; # ajout Stéphane
} # ajout Stéphane
elsif ($mesh_format ge "2.1") # ajout Stéphane # modif version 1.8
{$champ[2] =~ s/\"+//g; # on retire les guillemets éventuelles # ajout Stéphane
$les_references{"$champ[1]"}= "$champ[2]"; # ajout Stéphane
}; # ajout Stéphane
#
# fin des modifications - Stéphane
#
};
print "\n les references ";
while ( (my $cle, my $valeur) = each %les_references)
{ print "\n ".$cle . ' => ' .$valeur;};
};

#------------------ fin de la lecture des tag qui vont servir pour fabriquer les références -------------



# ++++++++++++++++++++++ lecture des coordonnées des noeuds ++++++++++++++++++++++++++
print ("\n lecture des coordonnees des noeuds ");
# on lit dans les lignes jusqu'au mot clé $Nodes
my $ligne;my @champ;
if ($position_sur_node != 1)
{ while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $Nodes
if ( $champ[0] eq '$Nodes' )
{$position_sur_node = 1;
last;}; # on a trouvé le premier enreg,
};
if ($position_sur_node != 1)
{ die ( "\n on n'a pas trouve le mot cle \$Nodes ?? , on ne peut pas continuer \n");
};
};

# --- on lit le nombre de noeud
$ligne = <fic_msh>; chomp($ligne);
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
print (" nombre total de noeuds lus : " . $champ[0] );
my $nb_noeud = $champ[0] ;

# --- on lit chaque ligne de coordonnée que l'on recopie dans un tableau jusqu'au mot clé $EndNodes
my @les_noeuds = () ; # déclaration du tableau des coordonnées des noeuds
while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $EndNodes
if ( $champ[0] eq '$EndNodes' )
{last;}; # on a trouvé le premier enreg,
# ce n'est pas le mot clé, donc on enregistre la ligne
push @les_noeuds, $ligne; # sauvegarde des coordonnées et du numéro initial du noeud
};


# ++++++++++++++++++++++ fin de lecture des coordonnees noeuds ++++++++++++++++++++++++++++++++++++

#-------- def de tableaux de conversion entre les numérotations gmsh et celles d'herezh++ ----------

# définition des types d'éléments

my @type_element = ( 'rien pour le numero 0', # '0'
'segment lineaire a 2 noeuds' , # '1'
'triangle lineaire a 3 noeuds' , # '2'
'quadrangle bilineaire a 4 noeuds' , # '3'
'tetrahedre lineaire a 4 noeuds' , # '4'
'hexahedre trilineaire a 8 noeuds' , # '5'
'pentaedre bilineaire a 6 noeuds' , # '6'
'pyramide a 5 noeuds' , # '7'
'segment quadratique a 3 noeuds' , # '8'
'triangle quadratique a 6 noeuds' , # '9'
'quadrangle quadratique complet a 9 noeuds' , #'10'
'tetraedre quadratique a 10 noeuds' , #'11'
'hexaedre quadratique complet a 27 noeuds' , #'12'
'pentaedre quadratique complet a 18 noeuds' , #'13'
'pyramide quadratique a 14 noeuds' , #'14'
' point a 1 noeud ' , #'15'
'quadrangle quadratique incomplet a 8 noeuds' , #'16'
'hexaedre quadratique incomplet a 20 noeuds' , #'17'
'pentaedre quadratique incomplet a 15 noeuds' , #'18'
'pyramide quadratique incomplete a 13 noeuds' #'19'
);

my @type_herezh_element = ( 'rien pour le numero 0', # '0'
' POUT BIE1 ' , # '1'
' TRIANGLE LINEAIRE ' , # '2'
' QUADRANGLE LINEAIRE ' , # '3'
' TETRAEDRE LINEAIRE ' , # '4'
' HEXAEDRE LINEAIRE ' , # '5'
' PENTAEDRE LINEAIRE ' , # '6'
' PYRAMIDE LINEAIRE ' , # '7'
' POUT QUADRATIQUE ' , # '8'
' TRIANGLE QUADRACOMPL ' , # '9'
' QUADRANGLE QUADRACOMPL ' , #'10'
' TETRAEDRE QUADRACOMPL ' , #'11'
' HEXAEDRE QUADRACOMPL ' , #'12'
' PENTAEDRE QUADRACOMPL ' , #'13'
' PYRAMIDE QUADRACOMPL ' , #'14'
' POINT LINEAIRE ' , #'15'
' QUADRANGLE QUADRATIQUE ' , #'16'
' HEXAEDRE QUADRATIQUE ' , #'17'
' PENTAEDRE QUADRATIQUE ' , #'18'
' PYRAMIDE QUADRATIQUE ' #'19'
);

# les types et nombre de points d'intégration pour chaque éléments:
# le premier chiffre indique le nombre de pti par défaut, si 0 : il n'y a pas plusieurs choix: un seul cas par défaut
# puis les différents cas
my @type_herezh_integration = ( [0], #'rien pour le numero 0', # '0'
[0], # ' POUT BIE1 ' , # '1'
[0], # ' TRIANGLE LINEAIRE ' , # '2'
[0], # ' QUADRANGLE LINEAIRE ' , # '3'
[0], # ' TETRAEDRE LINEAIRE ' , # '4'
[8,1,27,64], # ' HEXAEDRE LINEAIRE ' , # '5'
[2,1,6], # ' PENTAEDRE LINEAIRE ' , # '6'
[0], # ' PYRAMIDE LINEAIRE ' , # '7'
[0], # ' POUT QUADRATIQUE ' , # '8'
[0], # ' TRIANGLE QUADRACOMPL ' , # '9'
[0], # ' QUADRANGLE QUADRACOMPL ' , #'10'
[0], # ' TETRAEDRE QUADRACOMPL ' , #'11'
[8,1,27,64], # ' HEXAEDRE QUADRACOMPL ' , #'12'
[6,9,12,18], #' PENTAEDRE QUADRACOMPL ' , #'13'
[0], # ' PYRAMIDE QUADRACOMPL ' , #'14'
[0], # ' POINT LINEAIRE ' , #'15'
[0], # ' QUADRANGLE QUADRATIQUE ' , #'16'
[8,1,27,64], # ' HEXAEDRE QUADRATIQUE ' , #'17'
[6,9,12,18], # ' PENTAEDRE QUADRATIQUE ' , #'18'
[0], # ' PYRAMIDE QUADRATIQUE ' #'19'
);

my @nbn_par_elem;
$nbn_par_elem[0]=0; $nbn_par_elem[1]=2; $nbn_par_elem[2]=3; $nbn_par_elem[3]=4;
$nbn_par_elem[4]=4; $nbn_par_elem[5]=8; $nbn_par_elem[6]=6; $nbn_par_elem[7]=5;
$nbn_par_elem[8]=3; $nbn_par_elem[9]=6; $nbn_par_elem[10]=9; $nbn_par_elem[11]=10;
$nbn_par_elem[12]=27; $nbn_par_elem[13]=18; $nbn_par_elem[14]=14; $nbn_par_elem[15]=1;
$nbn_par_elem[16]=8; $nbn_par_elem[17]=20; $nbn_par_elem[18]=15; $nbn_par_elem[19]=13;
# $connex[i][j] donne pour l'element i, le num de gmsh pour le numéro j d'herezh
my @connex = ( [], # le premier avec rien, pour que la numérotation commence à 1
[1,2], # 1: ' POUT BIE1 ' ,
[1,2,3], # 2: ' TRIANGLE LINEAIRE ' ,
[1,2,3,4], # 3: ' QUADRANGLE LINEAIRE ' ,
[1,2,3,4], # 4: ' TETRAEDRE LINEAIRE ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8], # 5: ' HEXAEDRE LINEAIRE ' ,
[1,2,3,4,5,6], # 6: ' PENTAEDRE LINEAIRE ' ,
[1,2,3,4,5], # 7: ' PYRAMIDE LINEAIRE ' ,
[1,3,2], # 8: ' POUT QUADRATIQUE ' ,
[1,2,3,4,5,6], # 9: ' TRIANGLE QUADRACOMPL ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8,9], # 10: ' QUADRANGLE QUADRACOMPL ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8,10,9], # 11: ' TETRAEDRE QUADRACOMPL ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,12,14,10,11,13,15,16,17,19,20,18,21,22,24,25,23,26,27], # 12: ' HEXAEDRE QUADRACOMPL ' ,
# [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27] uniquement pour voir les numéros
[1,2,3,4,5,6,7,10,8,9, 11,12,13,15,14,16,18,17], # 13:' PENTAEDRE QUADRACOMPL ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14], # 14:' PYRAMIDE QUADRACOMPL ' ,
[1], # 15: ' POINT LINEAIRE ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8], # 16: ' QUADRANGLE QUADRATIQUE ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,12,14,10,11,13,15,16,17,19,20,18], # 17: ' HEXAEDRE QUADRATIQUE ' ,
# [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20], # 17: ' HEXAEDRE QUADRATIQUE ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,10,8,9, 11,12,13,15,14], # 18:' PENTAEDRE QUADRATIQUE ' ,
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13], # 19: ' PYRAMIDE QUADRATIQUE '
);
my @type_geom =
( 'RIEN_TYPE_GEOM', # '0'
'LIGNE' , # '1'
'SURFACE' , # '2'
'SURFACE' , # '3'
'VOLUME' , # '4'
'VOLUME' , # '5'
'VOLUME' , # '6'
'VOLUME' , # '7'
'LIGNE' , # '8'
'SURFACE' , # '9'
'SURFACE' , #'10'
'VOLUME' , #'11'
'VOLUME' , #'12'
'VOLUME' , #'13'
'VOLUME' , #'14'
'POINT_G' , #'15'
'SURFACE' , #'16'
'VOLUME' , #'17'
'VOLUME' , #'18'
'VOLUME' #'19'
);

#-------- fin def de tableaux de conversion entre les numérotations gmsh et celles d'herezh++ ----------

# ++++++++++++++++++++++ lecture des éléments +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
print ("\n lecture des elements ");

while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $Elements
if ( $champ[0] eq '$Elements' )
{last;}; # on a trouvé le premier enreg,
};

# ----- on lit le nombre d'éléments
$ligne = <fic_msh>; chomp($ligne);
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
print (" nombre total d'elements lus : " . $champ[0] );
my $nb_element = $champ[0] ;

# --- on lit chaque ligne que l'on recopie dans des tableaux jusqu'au mot clé $EndElements
my @liste_element = (); # ce sera un tableau multidimentionel
# chaque élément de @liste_element est une liste d'éléments d'un m^eme type
# $liste_element[i] = la liste des éléments de type i
# $liste_element[i][j] un élément = une liste d'entiers donc un tableau
# $liste_element [i][j][k] = un scalaire (entier) ouf !!

my @number_type = (); # les nombres d'élément de chaque type

while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $EndElements
if ( $champ[0] eq '$EndElements' )
{last;}; # on a trouvé le premier enreg,
# traitement et enregistrement
push @{$liste_element[$champ[1]]}, [@champ ]; # tableau multidimentionnel, syntaxe particulière
#if ( $champ[1] == 15)
# {print "\n trouve " . @champ; print " ligne = " . $ligne;
# print ",,, " .$champ[0]." ".$champ[1]." ".$champ[2]." ".$champ[3]." ".$champ[4]." ".$champ[5]." ";};
$number_type[$champ[1]]++;
};


# test débug
#print "\n essai= " . $liste_element[15][1][3] ;
#print "\n une tranche

# on recherche le nombre d'élément différent
my $nb_type_elem = 0;
my $taille_list_elem = $#liste_element;
#print "\n number_type = " . @number_type;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0)
{ print "\n nombre d'elements du type ".$type_element[$j] ." = " . $number_type[$j] ;
$nb_type_elem++;
};
};

print "\n nombre initial d'elements differents " . $nb_type_elem ;

# maintenant on demande si l'on veut tous les éléments ou certain uniquement

my @number_type_initial = @number_type; # sauvegarde pour le traitement des références
print "\n\n === choix d'elements: voulez-vous ? ";
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0)
{ print "\n conserver les elements du type ".$type_element[$j] ." (rep o ou n) " ;
my $rep = <STDIN>; chomp($rep); $rep=lc($rep); # lc passage en minuscule
if ($rep eq 'o')
{print (' ===> ok, on conserve les elements '.$type_element[$j] . "\n");}
else
{print (' *** on supprime les elements '.$type_element[$j] .'*** '. "\n");
$number_type[$j] = 0;
}
};
};

# on demande éventuellement le nombre de point d'intégration
my @type_out_integration; # le tableau contenant les types d'integration
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0) # on ne traite que les éléments que l'on a gardé
{if ($type_herezh_integration[$j] == 0)
{$type_out_integration[$j] = ' '; }#push @type_out_integration, ' ';} # rien pour la sortie
else
{ # cas où plusieurs type de point d'intégration sont possible
print ($type_element[$j].": nombre de points d'integration par defaut ".$type_herezh_integration[$j][0]." ? (rep o/n) ");
my $rep = <STDIN>; chomp($rep); $rep=lc($rep); # lc passage en minuscule
if ($rep eq 'o')
{$type_out_integration[$j] = ' '; }
else
# cas où plusieurs choix existent
{ print (" valeur preconisee parmi: ");
foreach my $nbpti ( @{$type_herezh_integration[$j]})
{ print ( $nbpti . " ");};
print (" : ? ");
my $rep = <STDIN>; chomp($rep);
if ($rep != $type_herezh_integration[$j][0])
{$type_out_integration[$j] = ' _cm'.$rep.'pti ';}
else {$type_out_integration[$j] = ' '; };
};
print ("\n");
}
};
};



# ++++++++++++++++++++++ fin lecture des éléments ++++++++++++++++++++++++++

# ++++++++++++++++++++++ création des références ++++++++++++++++++++++++++++++

# les références de noeuds se trouvent par l'intermédiaire des éléments "points"
# on passe donc en revue ces éléments
my %ref_noeud; # def de conteneur des références de noeuds
my %ref_element; # def du conteneur des références d'éléments
my %ref_arete; # def du conteneur des références d'arretes
my %ref_surface; # def du conteneur des références de surfaces
#print "\n taille de la liste d'elem = " . $taille_list_elem;
my $numero = 1;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ #print "\n taille des elem = " . $number_type[$j] ;
# !!! la sélection est maintenant faite à l'intérieur de la boucle
# c'est moins performant mais cela permet d'avoir des ref de points de ligne, surface, volume
# m^eme si ces derniers ne sont pas sélectionné comme éléments à retenir !!
# if (($number_type[$j] != 0) || ($liste_element[$j][0][1] == 15))
{ my $nb_el = $number_type_initial[$j];
#print "\n nb_el= ".$nb_el;
for (my $el = 0;$el < $nb_el;$el++)
{
# ------- cas des références de noeuds -----
if ($liste_element[$j][$el][1] == 15) # 15 c'est le type point
{ # on balaie les tag pour ajouter
my $nbtag = $liste_element[$j][$el][2]; # récup du nombre de tag
# on différencie les deux derniers tags qui sont :
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# en fait pour les points il semble qu'il n'y ait que un tag sup, donc on va jusqu'à $nbtag-1
# --- tout d'abord les tag des noms physiques (ceux qui ne sont pas généré automatiquement)
for (my $ic = 0; $ic < $nbtag-1; $ic++)
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
#print "\n indicateur de la reference : ".$indic_ref;
my $nbnoe = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag]; # le numéro du noeud
# $les_references{"$indic_ref"} = le nom de la référence, si ce n'est pas directement le nombre
my $nom = $les_references{"$indic_ref"};
#print "\n l equivalent d'indicateur de ref ".$nom;
if ($nom ne undef)
{ # cas ou le nom de la référence existe
if ( $ref_noeud{'N_' . $nom} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($nbnoe);
#print "\n la cle = " . 'N_' . $nom;
$ref_noeud{'N_' . $nom} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ #print "\n la cle = " . 'N_' . $nom;
push @{$ref_noeud{'N_' . $nom}}, $nbnoe;
};
}
else
{ # cas ou le nom de la référence n'existe pas, on utilise directement le nombre
if ( $ref_noeud{'N_' ."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($nbnoe);
$ref_noeud{'N_' ."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ push @{$ref_noeud{'N_' ."$indic_ref"}}, $nbnoe;
};
};
}
# --- puis les 2 tags automatique:
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# en fait pour les points il semble qu'il n'y ait que un tag sup, donc on va jusqu'à $nbtag-1
my $geoParti = 1; # pour choisir entre les deux
for (my $ic = $nbtag-1 ; $ic < $nbtag; $ic++,$geoParti++)
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
#print "\n indicateur de la reference : ".$indic_ref;
my $nbnoe = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag]; # le numéro du noeud
# ici il s'agit exclusiment de nombre, on l'utilise directement
# on signale la différence avec $geoParti
if ( $ref_noeud{'N_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($nbnoe);
$ref_noeud{'N_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ push @{$ref_noeud{'N_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"}}, $nbnoe;
};
};

}
else # diff de 15 donc éléments normal
# ------- cas des références d'éléments -----
# on va également créer des références de noeuds correspondants à chaques références particulières
# d'éléments ce qui permettra d'avoir des ref des noeuds de lignes, de surfaces ou de volumes particulières
{ # on balaie les tag pour ajouter
my $tyyp = $liste_element[$j][$el][1]; # le type de l'élément
my $nbtag = $liste_element[$j][$el][2]; # récup du nombre de tag
# on différencie les deux derniers tags qui sont :
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# --- tout d'abord les tag des noms physiques (ceux qui ne sont pas généré automatiquement)
my %tag_deja_traite;
my $fin_tag = $nbtag-2; # ajout Stéphane version 1.8
if ($mesh_format ge "2.2") {$fin_tag++;}; # ajout Stéphane version 1.8
for (my $ic = 0; $ic < $fin_tag; $ic++) # ajout Stéphane version 1.8
# for (my $ic = 0; $ic < $nbtag-2; $ic++) # modif Stéphane version 1.8
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
# dans le cas où il y a un nom de référence, l'indicateur de référence est doublé
# ce qui n'est pas normal, on supprime ce doublement
if ($tag_deja_traite{"$indic_ref"} ne undef)
{next;}
$tag_deja_traite{"$indic_ref"} = '1'; # de maniere à pas avoir de undef
#print "\n indicateur de la reference : ".$indic_ref;
# $les_references{"$indic_ref"} = le nom de la référence, si ce n'est pas directement le nombre
my $nom = $les_references{"$indic_ref"};
#print "\n l equivalent d'indicateur de ref ".$nom;
if ($nom ne undef)
{ # cas ou le nom de la référence d'élément existe (on applique les m^eme règles pour les N associés)
if ( $ref_element{'E_' . $nom} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{
#print "\n la cle = " . 'E_' . $nom;
# on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ my @tab = ($numero);
$ref_element{'E_' . $nom} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ my @tab_S = ($numero);
$ref_surface{'F_' . $nom} = [@tab_S]; # on sauvegarde le tableau
};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ my @tab_L = ($numero);
$ref_arete{'A_' . $nom} = [@tab_L]; # on sauvegarde le tableau
};
};
}
else
{ #print "\n la cle = " . 'E_' . $nom;
# on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ push @{$ref_element{'E_' . $nom}}, $numero;
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ push @{$ref_surface{'F_' . $nom}}, $numero;};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ push @{$ref_arete{'A_' . $nom}}, $numero;};
};
};
# idem pour la ref de noeuds associés, mais ici dans tous les cas
if ( $ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'.$nom} == undef)
{ my @t_noeud_ref_elem; # on sauvegarde le tableau (mais ici pour l'instant sans rien dedans)
$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'.$nom} = [@t_noeud_ref_elem];
};
# on rempli le tableau de num de noeud pour la ref de noeuds associé
for (my $ia =0;$ia < $nbn_par_elem[$tyyp]; $ia++)
{ my $bb = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag + $ia ]; # le numero de noeud
push @{$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'.$nom}}, $bb;
};
}
else
{ # cas ou le nom de la référence n'existe pas, on utilise directement le nombre
if ( $ref_element{'E_' ."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ # on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ my @tab = ($numero);
$ref_element{'E_' ."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ my @tab_S = ($numero);
$ref_surface{'F_' ."$indic_ref"} = [@tab_S]; # on sauvegarde le tableau
};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ my @tab_L = ($numero);
$ref_arete{'A_' . "$indic_ref"} = [@tab_L]; # on sauvegarde le tableau
};
};
}
else
{ # on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ push @{$ref_element{'E_' ."$indic_ref"}}, $numero;
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ push @{$ref_surface{'F_' . "$indic_ref"}}, $numero;};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ push @{$ref_arete{'A_' . "$indic_ref"}}, $numero;};
};
};
# idem pour la ref de noeuds associés, mais ici dans tous les cas
if ( $ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'."$indic_ref"} == undef)
{ my @t_noeud_ref_elem; # on sauvegarde le tableau (mais ici pour l'instant sans rien dedans)
$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'."$indic_ref"} = [@t_noeud_ref_elem];
};
# on rempli le tableau de num de noeud pour la ref de noeuds associé
for (my $ia =0;$ia < $nbn_par_elem[$tyyp]; $ia++)
{ my $bb = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag + $ia ]; # le numero de noeud
push @{$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'."$indic_ref"}}, $bb;
};
};
}
# --- puis les 2 tags automatique:
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ my $geoParti = 1; # pour choisir entre les deux
for (my $ic = $nbtag-2 ; $ic < $nbtag; $ic++,$geoParti++)
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
# dans le cas où il y a un nom de référence, l'indicateur de référence est doublé
# ce qui n'est pas normal, on supprime ce doublement
if ($tag_deja_traite{"$indic_ref"} ne undef)
{next;}
$tag_deja_traite{"$indic_ref"} = '1'; # de maniere à pas avoir de undef
{ # cas ou le nom de la référence n'existe pas, on utilise directement le nombre
if ( $ref_element{'E_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($numero);
$ref_element{'E_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ push @{$ref_element{'E_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"}}, $numero;
};
};
};
};

};
# on suit le cas de l'écriture finale des éléments donc on n'incrémente le numéro
# d'élément que s'il sera écrit
if ($number_type[$j] != 0)
{ $numero++;};
};
};
};


# --- maintenant, pour les références de noeuds on va supprimer les doublons, car le mode
# de construction des références d'éléments entra^ine systématiquement des doublons
foreach my $refno(keys %ref_noeud)
{ # on crée une table de hachage de num de noeuds
my %les_noeuds;
# on parcours les numéros que l'on stocke dans la table (mais ici le mode de stockage
# conduit à pas de doublon
foreach my $nbnoeu ( @{$ref_noeud{$refno}})
{ $les_noeuds{$nbnoeu} = $nbnoeu;};
# maintenant on crée un tableau intermédiaire qui va contenir les noeuds définitif
my @noeuds_def;
foreach my $cle (sort keys %les_noeuds)
{ push @noeuds_def,$les_noeuds{$cle};
};
# enfin on remplace le tableau associé à la référence de noeud par celui que l'on vient de créer
$ref_noeud{$refno} = [@noeuds_def];
};


# ++++++++++++++++++++++ fin création des références ++++++++++++++++++++++++++


print ("\n ");

close (fic_msh);


#====================== écriture du fichier .her ============================

#------------------- écriture de l'entete du fichier .her ---------------------

print fic_her ("\n");
print fic_her ("\n" . '#############################################################################');
print fic_her ("\n" . '# #');
print fic_her ("\n" . '# msh2her.pl #');
print fic_her ("\n" . '# transformation d\'un maillage genere par le programme gmsh #');
print fic_her ("\n" . '# en un maillage utilisable par Herezh++ #');
print fic_her ("\n" . '#############################################################################');
print fic_her ("\n" . '# licence GPL, gerard.rio@univ-ubs.fr #');
print fic_her ("\n" . '# http://www-lg2m.univ-ubs.fr/~rio #');
print fic_her ("\n" . '# version '."$version".' #');
print fic_her ("\n" . '#############################################################################');
print fic_her ("\n\n\n");
my $nom_maillage = $fichier_her;
$nom_maillage =~ s/\.her//;
print fic_her ("\n nom_maillage ".$nom_maillage ."\n\n");
#------------------- écriture des noeuds ---------------------

# ------ entete des noeuds --------

print fic_her ("\n" . ' noeuds ------------');
print fic_her ("\n $nb_noeud NOEUDS "); # ici écriture du nombre de noeuds
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' #|NO DU| X | Y | Z |');
print fic_her ("\n" . ' #|NOEUD| | | |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

# ------ la liste des coordonnées des noeuds --------
for (my $k=0; $k < $nb_noeud; $k++)
{ my $enreg = @les_noeuds[$k];
@champ = split (/\s+/,$enreg); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# print fic_her ("\n ". ($k+1) ." ". $champ[1] ." ". $champ[2] ." ". $champ[3] );
print fic_her ("\n ". $champ[0] ." ". $champ[1] ." ". $champ[2] ." ". $champ[3] );
}
print fic_her ("\n\n\n");

# ------ liste de références de noeuds -----------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references de noeuds |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refno(keys %ref_noeud)
{ print fic_her ( "\n ".$refno . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnoeu ( @{$ref_noeud{$refno}})
{ print fic_her ( $nbnoeu . " ");
$compteur++;
if ($compteur > 20)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};

#------------------- fin écriture des noeuds ---------------------

#-------------------- écriture des éléments --------------------

print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # les elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');

# ------ entete des éléments --------

# on compte les éléments à sortir
my $nb_elementASortir = 0;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0)
{ $nb_elementASortir += $number_type[$j];};
};


print fic_her ("\n" . ' elements ------------');
print fic_her ("\n $nb_elementASortir ELEMENTS "); # ici écriture du nombre de noeuds
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #----------------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' #| NO | | |');
print fic_her ("\n" . ' #|ELTS | type element | Noeuds |');
print fic_her ("\n" . ' #----------------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

# ------ écriture des éléments ------

my $numero = 1;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0)
{ my $nb_el = $number_type[$j];
for (my $el = 0;$el < $nb_el;$el++)
{ my $nbtag = $liste_element[$j][$el][2];
# écriture du numéro de l'élément puis du descriptif
print fic_her ("\n ". $numero ." ". $type_herezh_element[$j] .$type_out_integration[$j]." ");
my $tyyp = $liste_element[$j][$el][1]; # le type de l'élément
#print " tyyp= ".$tyyp."\n";
for (my $ia =0;$ia < $nbn_par_elem[$j]; $ia++)
{ # $ia = numéro d'ordre du noeud au format gmsh
# $connex[$tyyp][$ia] = numéro d'ordre du noeud au format herezh++
#print " ia= " . $ia ." connex= " . $connex[$tyyp][$ia]." ";
my $bb = $liste_element[$j][$el][2+ $nbtag + $connex[$tyyp][$ia] ]; # le numero herezh
print fic_her ( $bb . " ");
};
$numero++;
}
};
};

# ------- écriture des références d'éléments ---------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refel(keys %ref_element)
{ print fic_her ( "\n ".$refel . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnelem ( @{$ref_element{$refel}})
{ print fic_her ( $nbnelem . " ");
$compteur++;
if ($compteur > 24)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};

# ------- écriture des références d'arete d'éléments ---------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references aretes elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refel(keys %ref_arete)
{ print fic_her ( "\n ".$refel . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnelem ( @{$ref_arete{$refel}})
{ print fic_her ( $nbnelem . " 1 ");
$compteur++;
if ($compteur > 15)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};

# ------- écriture des références de faces d'éléments ---------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references de faces elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refel(keys %ref_surface)
{ print fic_her ( "\n ".$refel . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnelem ( @{$ref_surface{$refel}})
{ print fic_her ( $nbnelem . " 1 ");
$compteur++;
if ($compteur > 15)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};


#------------------- fin écriture des éléments ---------------------



print fic_her ("\n\n\n");
close (fic_her); # fermeture du fichier de maillage .her

print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n" . '# msh2her.pl #');
print ("\n" . '# fin creation du fichier de maillage .her #');
print ("\n" . '#############################################################################'."\n\n");


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