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Programme: msh2her.pl » msh2her.pl

version 2.5 (ajout options; voir aide -h) - Julien Troufflard, 11/09/2025 18:22

 
#!/usr/bin/perl
use strict;

##################################################################################################
# script pour passer du format de maillage genere par gmsh au format lu par herezh++ #
# version 1: version initiale #
# version 1.1: 30 avr 2008 prise en compte du fait qu'il peut ne pas y avoir de reference #
# de type chaine de caractères #
# version 1.2: 9 mai 2008 Dans le cas où on ne conserve pas les éléments noeuds, on conserve #
# quand m^eme les références associées. Au niveau des tag on différencie entre #
# 1) les physical name (c'est-à-dire les ref que l'on met #
# 2) le numéro de l'entité géométrique élémentaires #
# 3) le numéro de la partition de maillage #
# version 1.3: 13 mai 2008 #
# 1) introduction de références d'aretes et de surfaces pour les #
# éléments lignes et surfaces (uniquement) #
# 2) construction de références de noeuds correspondants aux refs d'éléments #
# que ces éléments soient concervés ou non #
# version 1.4: 23 mai 2008 #
# correction d'un bug sur l'affichage du nombre total d'element #
# version 1.5: 6 fevrier 2009 #
# correction de la numérotation pour les éléments quadratiques #
# suppression blancs et tab en debut de ligne, en lecture du .msh #
# version 1.6: 13 avril 2010 - S. Bochard #
# maillage msh au format 2.1 depuis gmsh-2.4 #
# correction lecture references pour sorties générées par gmsh-2.4 #
# version 1.7: 5 fevrier 2011 #
# re-correction de la numérotation pour les éléments quadratiques #
# hexaedre incomplet, introduction du nombre de pti #
# version 1.8: 19 octobre 2011 - S. Bochard #
# maillage msh au format 2.2 depuis gmsh-2.5 #
# correction format maillage 2.1 et supérieur pour gmsh 2.4 et 2.5 #
# version 1.9: 1 fevrier 2012 - G. Rio #
# correction bug sur la sortie des tetraedres quadratiques #
# version 2.0: 10 decembre 2012 - G. Rio #
# correction bug sur la sortie des tetraedres quadratiques #
# version 2.1: 15 decembre 2012 - G. Rio #
# correction bug sur la sortie des tetraedres quadratiques #
# version 2.2: 2 decembre 2015 - G. Rio #
# ajout du nom du type d'élément, quand question nombre de pti #
# version 2.3: 19 fevrier 2017 - G. Rio #
# sortie sytématique du nom du fichier traité #
# version 2.4: 26 novembre 2018 - G. Rio #
# modification de POUT QUADRATIQUE en pout BIE2 #
# version 2.5: 11 septembre 2025 - J. Troufflard #
# - divers correctifs mineurs pour supprimer tous les warnings obtenus quand on #
# verifie le script en faisant : perl -cw msh2her.pl #
# - ajout de l element QUADRANGLE CUBIQUE #
# - suppression des noeuds non references (noeuds appartenant a aucun element) #
# - ajout option -axi (transformer les elements 1D/2D en elements axisymetriques)#
# - ajout option -nom_ref_strict (nommer les listes de reference en respectant #
# strictement les noms indiques dans le fichier #
# .geo dans les "Physical Line/Surface/Volume") #
# - ajout option -only_ref (permet de specifier les listes de reference que l on #
# souhaite garder dans le fichier .her) #
# - modif de l aide -h #
##################################################################################################

my $nom;
my $version = "2.5";

my $EN_TETE_MSH2ER = "
#############################################################################
# #
# msh2her.pl #
# transformation d\'un maillage genere par le programme gmsh #
# en un maillage utilisable par Herezh++ #
#############################################################################
# licence GPL, gerard.rio\@univ-ubs.fr #
# http://www-lg2m.univ-ubs.fr/\~rio #
# version $version #
#############################################################################
";


if ($ARGV[0] eq '-h')
# si premier argument est -h : on donne le mode d'emploi
{
print ("\n");
print $EN_TETE_MSH2ER;
print ("\n");
print ("\n usage: msh2her.pl ");
print ("\n ----> entree interactive des noms de fichier \n");
print ("\n usage: msh2her.pl <nom fichier.msh> <nom fichier.her> \n");
print ("\n ----> indication de la source et de la cible ");
print ("\n NB: les noms de fichier peuvent avoir ou non leur extension \n");
print ("\n usage: msh2her.pl -v ");
print ("\n ----> affiche la version du programme \n");
print ("\n usage: msh2her.pl -h ");
print ("\n ----> information sur l'utilisation \n");
print ("\n");
print ("\n options :\n");
print ("\n -axi : convertir les element 1D et 2D en elements axi\n");
print ("\n");
print ("\n -nom_ref_strict : nommer les listes de reference en respectant strictement\n");
print (" les noms indiques dans le fichier .geo dans les \n");
print (" \"Physical Line/Surface/Volume\"\n");
print (" (suppression des suffixes _LIGNE, _SURFACE, _VOLUME)\n");
print ("\n");
print ("\n -only_ref nom_1 [... nom_N] end : ne garder que les listes de references\n");
print (" dont le nom figure dans cette option\n");
print (" (NB : terminer la liste par le mot \"end\")\n");
print ("\n\n");
exit(0);
}
elsif ($ARGV[0] eq '-v')
# si premier argument est -v : on donne le numero de version
{ print ("\n msh2her.pl: version "."$version"."\n\n");
exit(0);
};

#------------------- écriture de l'entete à l'écran -----------------
print ("\n");
print $EN_TETE_MSH2ER;
print ("\n");


#------------------- fin écriture de l'entete à l'écran -----------------




#------------------- verif presence d options dans les arguments --------------------
#MODIF J. Troufflard : premier balayage des arguments pour recuperer d eventuelles options

my $is_opt_axi = 0;#indicateur de l option -axi (transformer les elements POUT, TRIANGLE, QUADRANGLE en SEG_AXI, TRIA_AXI, QUAD_AXI)
my $is_opt_nom_ref_strict = 0;#indicateur de l option -nom_ref_strict (nommer les listes de reference en respectant strictement les noms utilises dans les "Physical" du fichier Gmsh .geo)
my $is_opt_only_ref = 0;#indicateur de l option -only_ref (ne conserver que les listes de references indiquees en arguments)
my @liste_only_ref = ();#liste des listes de reference a garder (option -only_ref ref_1 ref_2 ... ref_N end)
# NB : si cette liste est vide mais que l option a ete utilise (i.e -only_ref end), aucune ref ne sera conservee
my @args;
while($#ARGV > -1) {
my $opt = shift(@ARGV);

#option -axi
if($opt eq '-axi') {
$is_opt_axi = 1;
}
#option -nom_ref_strict
elsif($opt eq '-nom_ref_strict') {
$is_opt_nom_ref_strict = 1;
}
#option -only_ref
elsif($opt eq '-only_ref') {
$is_opt_only_ref = 1;
my $is_end = 0;
while($#ARGV > -1) {
$opt = shift(@ARGV);

if($opt eq 'end') {
$is_end = 1;
last;
}

push(@liste_only_ref, $opt);
}
$is_end or die "\nErreur (opt:-only_ref) : le mot-cle \"end\" n a pas ete trouve...\n\n";
}

#autre arguments
else {
push(@args, $opt);
}
}

#on remet les arguments dans @ARGV pour le fonctionnement normal de msh2her.pl
@ARGV = @args;

#si option -only_ref : on indique sa presence avec rappel des listes de reference choisies
if($is_opt_only_ref) {
print "\n";
print "**option -only_ref :\n";
print " seules les listes de reference ci-dessous figureront dans le fichier .her :\n";
print " (si elles existent)\n";
if($#liste_only_ref != -1) {
print " > $_\n" for @liste_only_ref;
}
else {
print " > aucune\n";
}
print "\n";
}
#------------------- fin verif presence d options dans les arguments --------------------



#------------------- on s'occupe tout d'abord des fichiers --------------------

# tout d'abord on récupère le nom du fichier à traiter
my $nombase;
if ($ARGV[0])
# si on a un argument, c'est le nom du fichier
{ $nombase = $ARGV[0];}
else
# sinon on demande interactivement le nom du fichier
{ print ("\n nom du fichier ? ");
$nombase = <STDIN>; chomp($nombase); # on supprime le retour à la ligne
};

# on supprime l'extension .msh si elle existe
$nombase =~ s/\.msh//;

# on ouvre le fichier msh en lecture tout d'abord, il doit donc exister
my $fichier_msh = $nombase . '.msh';
open (fic_msh,$fichier_msh) || die (" \n erreur en ouverture du fichier " . $fichier_msh . " \n");
print (" --> traitement du fichier $fichier_msh ---\n ");

# on ouvre le fichier .her en écriture, on écrase donc le fichier existant
my $fichier_her;
if ($ARGV[1])
# si on a un argument 2, c'est le nom du fichier de sortie
{ $fichier_her = $ARGV[1];}
else
# sinon on construit le nom du fichier
{$fichier_her = $nombase . '.her';
# on regarde s'il existe déj?
foreach (<*.her>)
{ if ($_ eq $fichier_her)
{ print ("\n le fichier " . $fichier_her . " existe deja ! ");
print ("\n voulez-vous l\' ecraser ? (0 ou N ) ");
my $rep = <STDIN>; chomp($rep); $rep=lc($rep); # lc passage en minuscule
if ($rep eq 'n')
{print ("\n nom du fichier de sortie ? ");
$fichier_her = <STDIN>; chomp($fichier_her);
};
};
}; # fin du foreach
};
# on supprime l'extension .her si elle existe
$fichier_her =~ s/\.her//;
# et on la rajoute
$fichier_her .= '.her';

# maintenant on tente l'ouverture de fichier
open (fic_her,">$fichier_her") || die (" \n erreur en ouverture du fichier " . $fichier_her . " \n");

#------------------------ fin des ouvertures de fichiers ---------------------


#------------------ lecture des tag qui vont servir pour fabriquer les références -------------
print ("\n lecture des tags (preparation a la creation des references) ");
# on lit dans les lignes jusqu'au mot clé $PhysicalNames
my $ligne;my @champ; my $existe_physicalNames = 0;
my $position_sur_node = 0; # pour signaler que l'on est à la position des noeuds
#
# debut des modifications - Stéphane
#
my $mesh_format; # ajout Stéphane
while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $PhysicalNames
if ( $champ[0] eq '$MeshFormat' ) # ajout Stéphane
{$ligne = <fic_msh>; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne suivante # ajout Stéphane
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne # ajout Stéphane
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces # ajout Stéphane
$mesh_format = $champ[0]; # on recupere le format du maillage # ajout Stéphane
print ("\n format de sauvegarde du maillage : msh " . $mesh_format . "\n" ); # ajout Stéphane
} # ajout Stéphane
if ( $champ[0] eq '$PhysicalNames' )
{$existe_physicalNames = 1;# on a trouvé le premier enreg,
last;
}
elsif ( $champ[0] eq '$Nodes' )
{$existe_physicalNames = 0;# on a pas trouvé de $PhysicalNames
print "\n **** NB: pas de chaine de caractere pour references a lire *****\n";
$position_sur_node = 1; # drapeau qui signale que l'on est au début des noeuds
last;
};
};


# --- on lit les tag si il en existe
my %les_references = () ; # déclaration de la table des reference
if ($existe_physicalNames)
{ $ligne = <fic_msh>; chomp($ligne);
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
print (" nombre total de references lus : " . $champ[0] );
my $nb_reference = $champ[0] ;

# --- on lit chaque ligne de reference que l'on recopie dans un tableau jusqu'au mot clé $EndPhysicalNames
while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $EndPhysicalNames
if ( $champ[0] eq '$EndPhysicalNames' )
{last;}; # on a trouvé le mot cle de fin de reference,
# ce n'est pas le mot clé, donc on enregistre la reference
if ($mesh_format eq "2") # ajout Stéphane
{$champ[1] =~ s/\"+//g; # on retire les guillemets éventuelles # ajout Stéphane
$les_references{"$champ[0]"}= "$champ[1]"; # ajout Stéphane
} # ajout Stéphane
elsif ($mesh_format ge "2.1") # ajout Stéphane # modif version 1.8
{$champ[2] =~ s/\"+//g; # on retire les guillemets éventuelles # ajout Stéphane
$les_references{"$champ[1]"}= "$champ[2]"; # ajout Stéphane
}; # ajout Stéphane
#
# fin des modifications - Stéphane
#
};
print "\n les references ";
while ( (my $cle, my $valeur) = each %les_references)
{ print "\n ".$cle . ' => ' .$valeur;};
};

#------------------ fin de la lecture des tag qui vont servir pour fabriquer les références -------------



# ++++++++++++++++++++++ lecture des coordonnées des noeuds ++++++++++++++++++++++++++
print ("\n lecture des coordonnees des noeuds ");
# on lit dans les lignes jusqu'au mot clé $Nodes
#MODIF J. Troufflard : ligne suivente en commentaire pour eviter warning ($ligne et @champ deja declares precedemment)
###############my $ligne;my @champ;
if ($position_sur_node != 1)
{ while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $Nodes
if ( $champ[0] eq '$Nodes' )
{$position_sur_node = 1;
last;}; # on a trouvé le premier enreg,
};
if ($position_sur_node != 1)
{ die ( "\n on n'a pas trouve le mot cle \$Nodes ?? , on ne peut pas continuer \n");
};
};

# --- on lit le nombre de noeud
$ligne = <fic_msh>; chomp($ligne);
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
print (" nombre total de noeuds lus : " . $champ[0] );
my $nb_noeud = $champ[0] ;

# --- on lit chaque ligne de coordonnée que l'on recopie dans un tableau jusqu'au mot clé $EndNodes
my @les_noeuds = () ; # déclaration du tableau des coordonnées des noeuds
while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $EndNodes
if ( $champ[0] eq '$EndNodes' )
{last;}; # on a trouvé le premier enreg,
# ce n'est pas le mot clé, donc on enregistre la ligne
push @les_noeuds, $ligne; # sauvegarde des coordonnées et du numéro initial du noeud
};


# ++++++++++++++++++++++ fin de lecture des coordonnees noeuds ++++++++++++++++++++++++++++++++++++

#-------- def de tableaux de conversion entre les numérotations gmsh et celles d'herezh++ ----------

# définition des types d'éléments

my @type_element = ( 'rien pour le numero 0' , # '0'
'segment lineaire a 2 noeuds' , # '1'
'triangle lineaire a 3 noeuds' , # '2'
'quadrangle bilineaire a 4 noeuds' , # '3'
'tetrahedre lineaire a 4 noeuds' , # '4'
'hexahedre trilineaire a 8 noeuds' , # '5'
'pentaedre bilineaire a 6 noeuds' , # '6'
'pyramide a 5 noeuds' , # '7'
'segment quadratique a 3 noeuds' , # '8'
'triangle quadratique a 6 noeuds' , # '9'
'quadrangle quadratique complet a 9 noeuds' , #'10'
'tetraedre quadratique complet a 10 noeuds' , #'11' #MODIF J. Troufflard : ajout de "complet"
'hexaedre quadratique complet a 27 noeuds' , #'12'
'pentaedre quadratique complet a 18 noeuds' , #'13'
'pyramide quadratique a 14 noeuds' , #'14'
' point a 1 noeud ' , #'15'
'quadrangle quadratique incomplet a 8 noeuds' , #'16'
'hexaedre quadratique incomplet a 20 noeuds' , #'17'
'pentaedre quadratique incomplet a 15 noeuds' , #'18'
'pyramide quadratique incomplete a 13 noeuds' , #'19'
'', #'20' #MODIF J. Troufflard : elements vides pour l instant
'', #'21' # .
'', #'22' # .
'', #'23' # .
'', #'24'
'', #'25'
'', #'26'
'', #'27'
'', #'28'
'', #'29'
'', #'30'
'', #'31'
'', #'32'
'', #'33'
'', #'34'
'', #'35'
'quadrangle cubique complet a 16 noeuds' #'36' #MODIF J. Troufflard : ajout de QUADRANGLE CUBIQUE
);

my @type_herezh_element = ( 'rien pour le numero 0', # '0'
' POUT BIE1 ' , # '1'
' TRIANGLE LINEAIRE ' , # '2'
' QUADRANGLE LINEAIRE ' , # '3'
' TETRAEDRE LINEAIRE ' , # '4'
' HEXAEDRE LINEAIRE ' , # '5'
' PENTAEDRE LINEAIRE ' , # '6'
' PYRAMIDE LINEAIRE ' , # '7'
' POUT BIE2 ' , # '8'
' TRIANGLE QUADRACOMPL ' , # '9'
' QUADRANGLE QUADRACOMPL ' , #'10'
' TETRAEDRE QUADRACOMPL ' , #'11'
' HEXAEDRE QUADRACOMPL ' , #'12'
' PENTAEDRE QUADRACOMPL ' , #'13'
' PYRAMIDE QUADRACOMPL ' , #'14'
' POINT LINEAIRE ' , #'15'
' QUADRANGLE QUADRATIQUE ' , #'16'
' HEXAEDRE QUADRATIQUE ' , #'17'
' PENTAEDRE QUADRATIQUE ' , #'18'
' PYRAMIDE QUADRATIQUE ' , #'19'
'', #'20' #MODIF J. Troufflard : elements vides pour l instant
'', #'21' # .
'', #'22' # .
'', #'23' # .
'', #'24'
'', #'25'
'', #'26'
'', #'27'
'', #'28'
'', #'29'
'', #'30'
'', #'31'
'', #'32'
'', #'33'
'', #'34'
'', #'35'
' QUADRANGLE CUBIQUE ' #'36' #MODIF J. Troufflard : ajout de QUADRANGLE CUBIQUE
);

# les types et nombre de points d'intégration pour chaque éléments:
# le premier chiffre indique le nombre de pti par défaut, si 0 : il n'y a pas plusieurs choix: un seul cas par défaut
# puis les différents cas
my @type_herezh_integration = ( [0], #'rien pour le numero 0', # '0'
[0], # '1' POUT BIE1
[0], # '2' TRIANGLE LINEAIRE
[0], # '3' QUADRANGLE LINEAIRE
[0], # '4' TETRAEDRE LINEAIRE
[8,1,27,64], # '5' HEXAEDRE LINEAIRE
[2,1,6], # '6' PENTAEDRE LINEAIRE
[0], # '7' PYRAMIDE LINEAIRE
[0], # '8' POUT BIE2 -> QUADRATIQUE
[0], # '9' TRIANGLE QUADRACOMPL
[0], #'10' QUADRANGLE QUADRACOMPL
[0], #'11' TETRAEDRE QUADRACOMPL
[8,1,27,64], #'12' HEXAEDRE QUADRACOMPL
[6,9,12,18], #'13' PENTAEDRE QUADRACOMPL
[0], #'14' PYRAMIDE QUADRACOMPL
[0], #'15' POINT LINEAIRE
[0], #'16' QUADRANGLE QUADRATIQUE
[8,1,27,64], #'17' HEXAEDRE QUADRATIQUE
[6,9,12,18], #'18' PENTAEDRE QUADRATIQUE
[0], #'19' PYRAMIDE QUADRATIQUE
[], #'20' # MODIF J. Troufflard : elements vides pour l instant
[], #'21' # .
[], #'22' # .
[], #'23' # .
[], #'24'
[], #'25'
[], #'26'
[], #'27'
[], #'28'
[], #'29'
[], #'30'
[], #'31'
[], #'32'
[], #'33'
[], #'34'
[], #'35'
[0] #'36' QUADRANGLE CUBIQUE #MODIF J. Troufflard : ajout de QUADRANGLE CUBIQUE
);

my @nbn_par_elem;
$nbn_par_elem[0]=0; $nbn_par_elem[1]=2; $nbn_par_elem[2]=3; $nbn_par_elem[3]=4;
$nbn_par_elem[4]=4; $nbn_par_elem[5]=8; $nbn_par_elem[6]=6; $nbn_par_elem[7]=5;
$nbn_par_elem[8]=3; $nbn_par_elem[9]=6; $nbn_par_elem[10]=9; $nbn_par_elem[11]=10;
$nbn_par_elem[12]=27; $nbn_par_elem[13]=18; $nbn_par_elem[14]=14; $nbn_par_elem[15]=1;
$nbn_par_elem[16]=8; $nbn_par_elem[17]=20; $nbn_par_elem[18]=15; $nbn_par_elem[19]=13;

$nbn_par_elem[36]=16;#MODIF J. Troufflard : ajout de QUADRANGLE CUBIQUE (16 noeuds)

# $connex[i][j] donne pour l'element i, le num de gmsh pour le numéro j d'herezh

my @connex = ( [], # le premier avec rien, pour que la numérotation commence à 1
[1,2], # 1: POUT BIE1
[1,2,3], # 2: TRIANGLE LINEAIRE
[1,2,3,4], # 3: QUADRANGLE LINEAIRE
[1,2,3,4], # 4: TETRAEDRE LINEAIRE
[1,2,3,4,5,6,7,8], # 5: HEXAEDRE LINEAIRE
[1,2,3,4,5,6], # 6: PENTAEDRE LINEAIRE
[1,2,3,4,5], # 7: PYRAMIDE LINEAIRE
[1,3,2], # 8: POUT BIE2 # pour QUADRATIQUE
[1,2,3,4,5,6], # 9: TRIANGLE QUADRACOMPL
[1,2,3,4,5,6,7,8,9], # 10: QUADRANGLE QUADRACOMPL
[1,2,3,4,5,6,7,8,10,9], # 11: TETRAEDRE QUADRACOMPL
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,12,14,10,11,13,15,16,17,19,20,18,21,22,24,25,23,26,27], # 12: HEXAEDRE QUADRACOMPL
# [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27] uniquement pour voir les numéros
[1,2,3,4,5,6,7,10,8,9, 11,12,13,15,14,16,18,17], # 13: PENTAEDRE QUADRACOMPL
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14], # 14: PYRAMIDE QUADRACOMPL
[1], # 15: POINT LINEAIRE
[1,2,3,4,5,6,7,8], # 16: QUADRANGLE QUADRATIQUE
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,12,14,10,11,13,15,16,17,19,20,18], # 17: HEXAEDRE QUADRATIQUE
# [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20], # 17: HEXAEDRE QUADRATIQUE
[1,2,3,4,5,6,7,10,8,9, 11,12,13,15,14], # 18: PENTAEDRE QUADRATIQUE
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13], # 19: PYRAMIDE QUADRATIQUE
[], #20
[], #21
[], #22
[], #23
[], #24
[], #25
[], #26
[], #27
[], #28
[], #29
[], #30
[], #31
[], #32
[], #33
[], #34
[], #35
[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16], # 36: #MODIF J. Troufflard : ajout de QUADRANGLE CUBIQUE
);

my @type_geom =
( 'RIEN_TYPE_GEOM', # '0'
'LIGNE' , # '1'
'SURFACE' , # '2'
'SURFACE' , # '3'
'VOLUME' , # '4'
'VOLUME' , # '5'
'VOLUME' , # '6'
'VOLUME' , # '7'
'LIGNE' , # '8'
'SURFACE' , # '9'
'SURFACE' , #'10'
'VOLUME' , #'11'
'VOLUME' , #'12'
'VOLUME' , #'13'
'VOLUME' , #'14'
'POINT_G' , #'15'
'SURFACE' , #'16'
'VOLUME' , #'17'
'VOLUME' , #'18'
'VOLUME' , #'19'
'', #'20'
'', #'21'
'', #'22'
'', #'23'
'', #'24'
'', #'25'
'', #'26'
'', #'27'
'', #'28'
'', #'29'
'', #'30'
'', #'31'
'', #'32'
'', #'33'
'', #'34'
'', #'35'
'SURFACE', #36 #MODIF J. Troufflard : ajout de QUADRANGLE CUBIQUE
);

#-------- fin def de tableaux de conversion entre les numérotations gmsh et celles d'herezh++ ----------


# ++++++++++++++++++++++ lecture des éléments +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
print ("\n lecture des elements ");

while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $Elements
if ( $champ[0] eq '$Elements' )
{last;}; # on a trouvé le premier enreg,
};

# ----- on lit le nombre d'éléments
$ligne = <fic_msh>; chomp($ligne);
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
print (" nombre total d'elements lus : " . $champ[0] );
my $nb_element = $champ[0] ;


# --- on lit chaque ligne que l'on recopie dans des tableaux jusqu'au mot clé $EndElements

my @liste_element = (); # ce sera un tableau multidimentionel
# chaque élément de @liste_element est une liste d'éléments d'un m^eme type
# $liste_element[i] = la liste des éléments de type i
# $liste_element[i][j] un élément = une liste d'entiers donc un tableau
# $liste_element [i][j][k] = un scalaire (entier) ouf !!

my @number_type = (); # les nombres d'élément de chaque type

while (<fic_msh>)
{ $ligne = $_; chomp($ligne); # sauvegarde de la ligne
$ligne =~ s/^[ \t]+//mg; # suppression des blancs et tabulation en début de ligne
@champ = split (/\s+/,$ligne); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# on lit dans le fichier jusqu'au mot clé $EndElements
if ( $champ[0] eq '$EndElements' )
{last;}; # on a trouvé le premier enreg,
# traitement et enregistrement
push @{$liste_element[$champ[1]]}, [@champ ]; # tableau multidimentionnel, syntaxe particulière
#if ( $champ[1] == 15)
# {print "\n trouve " . @champ; print " ligne = " . $ligne;
# print ",,, " .$champ[0]." ".$champ[1]." ".$champ[2]." ".$champ[3]." ".$champ[4]." ".$champ[5]." ";};
$number_type[$champ[1]]++;
};


# test débug
#print "\n essai= " . $liste_element[15][1][3] ;
#print "\n une tranche

# on recherche le nombre d'élément différent
my $nb_type_elem = 0;
my $taille_list_elem = $#liste_element;
#print "\n number_type = " . @number_type;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{
#MODIF J. Troufflard : ajout conditionnelle "defined" pour eviter warning en cas de $number_type[$j]
# non renseigne pour certaines valeurs de $j (Use of uninitialized value etc...)
if (defined $number_type[$j] and $number_type[$j] != 0)
{ print "\n nombre d'elements du type ".$type_element[$j] ." = " . $number_type[$j] ;
$nb_type_elem++;
};
};

print "\n nombre initial d'elements differents " . $nb_type_elem ;

# maintenant on demande si l'on veut tous les éléments ou certain uniquement

my @number_type_initial = @number_type; # sauvegarde pour le traitement des références
print "\n\n === choix d'elements: voulez-vous ? ";
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{
#MODIF J. Troufflard : ajout conditionnelle "defined" pour eviter warning en cas de $number_type[$j]
# non renseigne pour certaines valeurs de $j (Use of uninitialized value etc...)
if (defined $number_type[$j] and $number_type[$j] != 0)
{ print "\n conserver les elements du type ".$type_element[$j] ." (rep o ou n) " ;
my $rep = <STDIN>; chomp($rep); $rep=lc($rep); # lc passage en minuscule
if ($rep eq 'o')
{print (' ===> ok, on conserve les elements '.$type_element[$j] . "\n");}
else
{print (' *** on supprime les elements '.$type_element[$j] .'*** '. "\n");
$number_type[$j] = 0;
}
};
};

# on demande éventuellement le nombre de point d'intégration
my @type_out_integration; # le tableau contenant les types d'integration
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0) # on ne traite que les éléments que l'on a gardé
{if ($type_herezh_integration[$j] == 0)
{$type_out_integration[$j] = ' '; }#push @type_out_integration, ' ';} # rien pour la sortie
else
{ # cas où plusieurs type de point d'intégration sont possible
print ($type_element[$j].": nombre de points d'integration par defaut ".$type_herezh_integration[$j][0]." ? (rep o/n) ");
my $rep = <STDIN>; chomp($rep); $rep=lc($rep); # lc passage en minuscule
if ($rep eq 'o')
{$type_out_integration[$j] = ' '; }
else
# cas où plusieurs choix existent
{ print (" valeur preconisee parmi: ");
foreach my $nbpti ( @{$type_herezh_integration[$j]})
{ print ( $nbpti . " ");};
print (" : ? ");
my $rep = <STDIN>; chomp($rep);
if ($rep != $type_herezh_integration[$j][0])
{$type_out_integration[$j] = ' _cm'.$rep.'pti ';}
else {$type_out_integration[$j] = ' '; };
};
print ("\n");
}
};
};



# ++++++++++++++++++++++ fin lecture des éléments ++++++++++++++++++++++++++

# ++++++++++++++++++++++ création des références ++++++++++++++++++++++++++++++

# les références de noeuds se trouvent par l'intermédiaire des éléments "points"
# on passe donc en revue ces éléments
my %ref_noeud; # def de conteneur des références de noeuds
my %ref_element; # def du conteneur des références d'éléments
my %ref_arete; # def du conteneur des références d'arretes
my %ref_surface; # def du conteneur des références de surfaces
#print "\n taille de la liste d'elem = " . $taille_list_elem;
my $numero = 1;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ #print "\n taille des elem = " . $number_type[$j] ;
# !!! la sélection est maintenant faite à l'intérieur de la boucle
# c'est moins performant mais cela permet d'avoir des ref de points de ligne, surface, volume
# m^eme si ces derniers ne sont pas sélectionné comme éléments à retenir !!
# if (($number_type[$j] != 0) || ($liste_element[$j][0][1] == 15))
{ my $nb_el = $number_type_initial[$j];
#print "\n nb_el= ".$nb_el;
for (my $el = 0;$el < $nb_el;$el++)
{
# ------- cas des références de noeuds -----

if ($liste_element[$j][$el][1] == 15) # 15 c'est le type point
{ # on balaie les tag pour ajouter
my $nbtag = $liste_element[$j][$el][2]; # récup du nombre de tag
# on différencie les deux derniers tags qui sont :
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# en fait pour les points il semble qu'il n'y ait que un tag sup, donc on va jusqu'à $nbtag-1
# --- tout d'abord les tag des noms physiques (ceux qui ne sont pas généré automatiquement)
for (my $ic = 0; $ic < $nbtag-1; $ic++)
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
#print "\n indicateur de la reference : ".$indic_ref;
my $nbnoe = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag]; # le numéro du noeud
# $les_references{"$indic_ref"} = le nom de la référence, si ce n'est pas directement le nombre
my $nom = $les_references{"$indic_ref"};
#print "\n l equivalent d'indicateur de ref ".$nom;
if ($nom ne undef)
{ # cas ou le nom de la référence existe
if ( $ref_noeud{'N_' . $nom} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($nbnoe);
#print "\n la cle = " . 'N_' . $nom;
$ref_noeud{'N_' . $nom} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ #print "\n la cle = " . 'N_' . $nom;
push @{$ref_noeud{'N_' . $nom}}, $nbnoe;
};
}
else
{ # cas ou le nom de la référence n'existe pas, on utilise directement le nombre
if ( $ref_noeud{'N_' ."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($nbnoe);
$ref_noeud{'N_' ."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ push @{$ref_noeud{'N_' ."$indic_ref"}}, $nbnoe;
};
};
};
# --- puis les 2 tags automatique:
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# en fait pour les points il semble qu'il n'y ait que un tag sup, donc on va jusqu'à $nbtag-1
my $geoParti = 1; # pour choisir entre les deux
for (my $ic = $nbtag-1 ; $ic < $nbtag; $ic++,$geoParti++)
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
#print "\n indicateur de la reference : ".$indic_ref;
my $nbnoe = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag]; # le numéro du noeud
# ici il s'agit exclusiment de nombre, on l'utilise directement
# on signale la différence avec $geoParti
if ( $ref_noeud{'N_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($nbnoe);
$ref_noeud{'N_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ push @{$ref_noeud{'N_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"}}, $nbnoe;
};
};
}

else # diff de 15 donc éléments normal
# ------- cas des références d'éléments -----
# on va également créer des références de noeuds correspondants à chaques références particulières
# d'éléments ce qui permettra d'avoir des ref des noeuds de lignes, de surfaces ou de volumes particulières
{ # on balaie les tag pour ajouter
my $tyyp = $liste_element[$j][$el][1]; # le type de l'élément
my $nbtag = $liste_element[$j][$el][2]; # récup du nombre de tag
# on différencie les deux derniers tags qui sont :
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# --- tout d'abord les tag des noms physiques (ceux qui ne sont pas généré automatiquement)
my %tag_deja_traite;
my $fin_tag = $nbtag-2;# ajout Stéphane version 1.8
if ($mesh_format ge "2.2") {$fin_tag++;};# ajout Stéphane version 1.8
for (my $ic = 0; $ic < $fin_tag; $ic++) # ajout Stéphane version 1.8
# for (my $ic = 0; $ic < $nbtag-2; $ic++) # modif Stéphane version 1.8
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
# dans le cas où il y a un nom de référence, l'indicateur de référence est doublé
# ce qui n'est pas normal, on supprime ce doublement
if ($tag_deja_traite{"$indic_ref"} ne undef)
{next;}
$tag_deja_traite{"$indic_ref"} = '1'; # de maniere à pas avoir de undef

#print "\n indicateur de la reference : ".$indic_ref;
# $les_references{"$indic_ref"} = le nom de la référence, si ce n'est pas directement le nombre
my $nom = $les_references{"$indic_ref"};
#print "\n l equivalent d'indicateur de ref ".$nom;
if ($nom ne undef)
{ # cas ou le nom de la référence d'élément existe (on applique les m^eme règles pour les N associés)
if ( $ref_element{'E_' . $nom} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{
#print "\n la cle = " . 'E_' . $nom;
# on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ my @tab = ($numero);
$ref_element{'E_' . $nom} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
#print "\n le type de geom = " . 'E_' . $nom;
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ my @tab_S = ($numero);
$ref_surface{'F_' . $nom} = [@tab_S]; # on sauvegarde le tableau
};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ my @tab_L = ($numero);
$ref_arete{'A_' . $nom} = [@tab_L]; # on sauvegarde le tableau
};
};
}
else
{ #print "\n la cle = " . 'E_' . $nom;
# on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ push @{$ref_element{'E_' . $nom}}, $numero;
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ push @{$ref_surface{'F_' . $nom}}, $numero;};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ push @{$ref_arete{'A_' . $nom}}, $numero;};
};
};

# idem pour la ref de noeuds associés, mais ici dans tous les cas
if ( $ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'.$nom} == undef)
{ my @t_noeud_ref_elem; # on sauvegarde le tableau (mais ici pour l'instant sans rien dedans)
$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'.$nom} = [@t_noeud_ref_elem];
};
# on rempli le tableau de num de noeud pour la ref de noeuds associé
for (my $ia =0;$ia < $nbn_par_elem[$tyyp]; $ia++)
{ my $bb = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag + $ia ]; # le numero de noeud
push @{$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'.$nom}}, $bb;
};
}
else
{ # cas ou le nom de la référence n'existe pas, on utilise directement le nombre
if ( $ref_element{'E_' ."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ # on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ my @tab = ($numero);
$ref_element{'E_' ."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ my @tab_S = ($numero);
$ref_surface{'F_' ."$indic_ref"} = [@tab_S]; # on sauvegarde le tableau
};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ my @tab_L = ($numero);
$ref_arete{'A_' . "$indic_ref"} = [@tab_L]; # on sauvegarde le tableau
};
};
}
else
{ # on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ push @{$ref_element{'E_' ."$indic_ref"}}, $numero;
# idem pour la ref de surfaces associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément de surface
if ($type_geom[$tyyp] eq "SURFACE")
{ push @{$ref_surface{'F_' . "$indic_ref"}}, $numero;};
# idem pour la ref d'arete associés, mais ici dans le cas ou c'est un élément linéique
if ($type_geom[$tyyp] eq "LIGNE")
{ push @{$ref_arete{'A_' . "$indic_ref"}}, $numero;};
};
};

# idem pour la ref de noeuds associés, mais ici dans tous les cas
if ( $ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'."$indic_ref"} == undef)
{ my @t_noeud_ref_elem; # on sauvegarde le tableau (mais ici pour l'instant sans rien dedans)
$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'."$indic_ref"} = [@t_noeud_ref_elem];
};
# on rempli le tableau de num de noeud pour la ref de noeuds associé
for (my $ia =0;$ia < $nbn_par_elem[$tyyp]; $ia++)
{ my $bb = $liste_element[$j][$el][3+ $nbtag + $ia ]; # le numero de noeud
push @{$ref_noeud{'N_'."$type_geom[$tyyp]".'_'."$indic_ref"}}, $bb;
};
};
};
# --- puis les 2 tags automatique:
# 1) le numéro de l'entité géométrique élémentaires
# 2) le numéro de la partition de maillage
# on n'intervient pour les ref d'éléments que si ces éléments sont à retenir
if ($number_type[$j] != 0)
{ my $geoParti = 1; # pour choisir entre les deux
for (my $ic = $nbtag-2 ; $ic < $nbtag; $ic++,$geoParti++)
{ my $indic_ref = $liste_element[$j][$el][3+$ic]; # l'indicateur de la référence
# dans le cas où il y a un nom de référence, l'indicateur de référence est doublé
# ce qui n'est pas normal, on supprime ce doublement
if ($tag_deja_traite{"$indic_ref"} ne undef)
{next;}
$tag_deja_traite{"$indic_ref"} = '1'; # de maniere à pas avoir de undef

{ # cas ou le nom de la référence n'existe pas, on utilise directement le nombre
if ( $ref_element{'E_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} == undef)
# si la référence n'est pas définie on la définie
{ my @tab = ($numero);
$ref_element{'E_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"} = [@tab]; # on sauvegarde le tableau
}
else
{ push @{$ref_element{'E_'."$geoParti".'_'."$indic_ref"}}, $numero;
};
};
};
};

};
# on suit le cas de l'écriture finale des éléments donc on n'incrémente le numéro
# d'élément que s'il sera écrit
if ($number_type[$j] != 0)
{ $numero++;};
};
};
};


# --- maintenant, pour les références de noeuds on va supprimer les doublons, car le mode
# de construction des références d'éléments entra^ine systématiquement des doublons
foreach my $refno(keys %ref_noeud)
{ # on crée une table de hachage de num de noeuds
my %les_noeuds;
# on parcours les numéros que l'on stocke dans la table (mais ici le mode de stockage
# conduit à pas de doublon
foreach my $nbnoeu ( @{$ref_noeud{$refno}})
{ $les_noeuds{$nbnoeu} = $nbnoeu;};
# maintenant on crée un tableau intermédiaire qui va contenir les noeuds définitif
my @noeuds_def;
foreach my $cle (sort keys %les_noeuds)
{ push @noeuds_def,$les_noeuds{$cle};
};
# enfin on remplace le tableau associé à la référence de noeud par celui que l'on vient de créer
$ref_noeud{$refno} = [@noeuds_def];
};


# ++++++++++++++++++++++ fin création des références ++++++++++++++++++++++++++


print ("\n ");

close (fic_msh);



#====================== écriture du fichier .her ============================

#------------------- écriture de l'entete du fichier .her ---------------------

print fic_her ("\n");
print fic_her $EN_TETE_MSH2ER;
print fic_her ("\n\n\n");
my $nom_maillage = $fichier_her;
$nom_maillage =~ s/\.her//;
print fic_her ("\n nom_maillage ".$nom_maillage ."\n\n");
#------------------- écriture des noeuds ---------------------

# ------ entete des noeuds --------

print fic_her ("\n" . ' noeuds ------------');
print fic_her ("\n $nb_noeud NOEUDS "); # ici écriture du nombre de noeuds
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' #|NO DU| X | Y | Z |');
print fic_her ("\n" . ' #|NOEUD| | | |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

# ------ la liste des coordonnées des noeuds --------
for (my $k=0; $k < $nb_noeud; $k++)
{ my $enreg = $les_noeuds[$k];
@champ = split (/\s+/,$enreg); # le /s+/ permet de séparer sur des espaces
# print fic_her ("\n ". ($k+1) ." ". $champ[1] ." ". $champ[2] ." ". $champ[3] );
print fic_her ("\n ". $champ[0] ." ". $champ[1] ." ". $champ[2] ." ". $champ[3] );
};
print fic_her ("\n\n\n");

# ------ liste de références de noeuds -----------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references de noeuds |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refno (keys %ref_noeud)
{
#MODIF J. Troufflard : option -nom_ref_strict
# => suppression des eventuels ajouts de "_LIGNE", "_SURFACE", "_VOLUME" dans
# les noms de liste de reference
my $nom_ref_a_ecrire = $refno;
if($is_opt_nom_ref_strict) {
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_LIGNE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_SURFACE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_VOLUME//;
}

#MODIF J. Troufflard : option -only_ref => on ne garde que les refs contenues dans la liste @liste_only_ref
next if($is_opt_only_ref and not " @liste_only_ref " =~ / $nom_ref_a_ecrire /);

print fic_her ( "\n ".$nom_ref_a_ecrire . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnoeu ( @{$ref_noeud{$refno}})
{ print fic_her ( $nbnoeu . " ");
$compteur++;
if ($compteur > 20)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};

#------------------- fin écriture des noeuds ---------------------

#-------------------- écriture des éléments --------------------

print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # les elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');

# ------ entete des éléments --------

# on compte les éléments à sortir
my $nb_elementASortir = 0;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0)
{ $nb_elementASortir += $number_type[$j];};
};


print fic_her ("\n" . ' elements ------------');
print fic_her ("\n $nb_elementASortir ELEMENTS "); # ici écriture du nombre de noeuds
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #----------------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' #| NO | | |');
print fic_her ("\n" . ' #|ELTS | type element | Noeuds |');
print fic_her ("\n" . ' #----------------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

# ------ écriture des éléments ------

$numero = 1;
for (my $j=1;$j<=$taille_list_elem;$j++)
{ if ($number_type[$j] != 0)
{ my $nb_el = $number_type[$j];
for (my $el = 0;$el < $nb_el;$el++)
{ my $nbtag = $liste_element[$j][$el][2];
# écriture du numéro de l'élément puis du descriptif
print fic_her ("\n ". $numero ." ". $type_herezh_element[$j] .$type_out_integration[$j]." ");
my $tyyp = $liste_element[$j][$el][1]; # le type de l'élément
#print " tyyp= ".$tyyp."\n";
for (my $ia =0;$ia < $nbn_par_elem[$j]; $ia++)
{ # $ia = numéro d'ordre du noeud au format gmsh
# $connex[$tyyp][$ia] = numéro d'ordre du noeud au format herezh++
#print " ia= " . $ia ." connex= " . $connex[$tyyp][$ia]." ";
my $bb = $liste_element[$j][$el][2+ $nbtag + $connex[$tyyp][$ia] ]; # le numero herezh
print fic_her ( $bb . " ");
};
$numero++;
}
};
};

# ------- écriture des références d'éléments ---------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refel (keys %ref_element)
{
#MODIF J. Troufflard : option -nom_ref_strict
# => suppression des eventuels ajouts de "_LIGNE", "_SURFACE", "_VOLUME" dans
# les noms de liste de reference
my $nom_ref_a_ecrire = $refel;
if($is_opt_nom_ref_strict) {
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_LIGNE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_SURFACE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_VOLUME//;
}

#MODIF J. Troufflard : option -only_ref => on ne garde que les refs contenues dans la liste @liste_only_ref
next if($is_opt_only_ref and not " @liste_only_ref " =~ / $nom_ref_a_ecrire /);

print fic_her ( "\n ".$nom_ref_a_ecrire . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnelem ( @{$ref_element{$refel}})
{ print fic_her ( $nbnelem . " ");
$compteur++;
if ($compteur > 24)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};

# ------- écriture des références d'arete d'éléments ---------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references aretes elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refel (keys %ref_arete)
{
#MODIF J. Troufflard : option -nom_ref_strict
# => suppression des eventuels ajouts de "_LIGNE", "_SURFACE", "_VOLUME" dans
# les noms de liste de reference
my $nom_ref_a_ecrire = $refel;
if($is_opt_nom_ref_strict) {
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_LIGNE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_SURFACE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_VOLUME//;
}

#MODIF J. Troufflard : option -only_ref => on ne garde que les refs contenues dans la liste @liste_only_ref
next if($is_opt_only_ref and not " @liste_only_ref " =~ / $nom_ref_a_ecrire /);

print fic_her ( "\n ".$nom_ref_a_ecrire . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnelem ( @{$ref_arete{$refel}})
{ print fic_her ( $nbnelem . " 1 ");
$compteur++;
if ($compteur > 15)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};

# ------- écriture des références de faces d'éléments ---------
print fic_her ("\n\n\n");
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n" . ' # references de faces elements |');
print fic_her ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print fic_her ("\n");

foreach my $refel (keys %ref_surface)
{
#MODIF J. Troufflard : option -nom_ref_strict
# => suppression des eventuels ajouts de "_LIGNE", "_SURFACE", "_VOLUME" dans
# les noms de liste de reference
my $nom_ref_a_ecrire = $refel;
if($is_opt_nom_ref_strict) {
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_LIGNE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_SURFACE//;
$nom_ref_a_ecrire =~ s/_VOLUME//;
}

#MODIF J. Troufflard : option -only_ref => on ne garde que les refs contenues dans la liste @liste_only_ref
next if($is_opt_only_ref and not " @liste_only_ref " =~ / $nom_ref_a_ecrire /);

print fic_her ( "\n ".$nom_ref_a_ecrire . " "); # le nom de la référence
my $compteur = 1;
foreach my $nbnelem ( @{$ref_surface{$refel}})
{ print fic_her ( $nbnelem . " 1 ");
$compteur++;
if ($compteur > 15)
{ print fic_her ("\n ");
$compteur = 1;
};
};
print fic_her ("\n ");
};


#------------------- fin écriture des éléments ---------------------



print fic_her ("\n\n\n");
close (fic_her); # fermeture du fichier de maillage .her




#MODIF J. Troufflard : lecture du maillage dans des variables pour effectuer diverses operations par la suite
my ($nb_noeuds, $ref_noeuds, $nb_elts, $ref_elements, @ref_listes);
($nom_maillage, $nb_noeuds, $ref_noeuds, $nb_elts, $ref_elements, @ref_listes) = lecture_mail_her($fichier_her);

#MODIF J. Troufflard : suppression des noeuds non references
# cette operation supprime les noeuds qui n appartiennent a aucun element
# et actualise en consequence les listes de references (reecriture complete du fichier .her)
suppr_noeuds_non_references($fichier_her, $nom_maillage, $nb_noeuds, $ref_noeuds, $nb_elts, $ref_elements, \@ref_listes);

#MODIF J. Troufflard : en cas d option -only_ref, on regarde si des listes demandees n ont pas ete trouvees
# en cas d absence de listes, on le signale dans le terminal
if($is_opt_only_ref) {
#recuperation de tous les noms de liste de reference du maillage actuel (dans une chaine de caracteres)
my $listes_ref = "";
#-- noeuds
foreach my $nom (keys(%{$ref_listes[0]})) {
$listes_ref .= " $nom";
}
#-- aretes
foreach my $nom (keys(%{$ref_listes[1]})) {
$listes_ref .= " $nom";
}
#-- faces
foreach my $nom (keys(%{$ref_listes[2]})) {
$listes_ref .= " $nom";
}
#-- elements
foreach my $nom (keys(%{$ref_listes[3]})) {
$listes_ref .= " $nom";
}
$listes_ref .= " ";

#verif des listes -only_ref
my @listes_manquantes;
foreach my $nom (@liste_only_ref) {
next if($listes_ref =~ / $nom /);
push(@listes_manquantes, $nom);
}
#si des listes manquent, on les affiche
if($#listes_manquantes != -1) {
print "\n";
print "**option -only_ref :\n";
print " les listes suivantes, requises par -only_ref, n ont pas ete trouvees :\n";
print " > $_\n" for @listes_manquantes;
print "\n";
}
}

#MODIF J. Troufflard : application de l option -axi => transformer les elements POUT, TRIANGLE et QUADRANGLE en SEG_AXI, TRIA_AXI et QUAD_AXI
if($is_opt_axi) {
print "\n";
print "**option -axi : transformation des elements POUT, TRIANGLE et QUADRANGLE en elements axisymetriques...\n";
print "\n";
open(FIC, "<$fichier_her");
open(FIC2, ">$fichier_her.abcdefgh$$.her");
while(<FIC>) {
s/^(\s*\d+\s+)POUT(\s+)/$1SEG_AXI$2/;
s/^(\s*\d+\s+)TRIANGLE(\s+)/$1TRIA_AXI$2/;
s/^(\s*\d+\s+)QUADRANGLE(\s+)/$1QUAD_AXI$2/;
print FIC2;
}
close(FIC);
close(FIC2);
system("mv -f $fichier_her.abcdefgh$$.her $fichier_her");
}#if($is_opt_axi)





print ("\n" . '#############################################################################');
print ("\n" . '#msh2her.pl #');
print ("\n" . '# fin creation du fichier de maillage .her #');
print ("\n" . '#############################################################################'."\n\n");







#MODIF J. Troufflard
#----------------
#sub qui gere la suppression des noeuds non references
# en entree : nom du fichier .her contenant le maillage
#
# fonctionnement :
# on part du maillage qui est ecrit une premiere fois par msh2her.pl avant l appel a cette sub
#
# etape 1) recuperation du maillage en entree via les variables fournies par la sub lecture_mail_her() (nom maillage, noeuds, etc...)
# etape 2) modification des variables (noeuds, elements, liste de ref) en fonction de la suppression des
# eventuels noeuds non references
# etape 3) reecriture du fichier maillage
# le maillage est reecrit en conservant le style du fichier produit auparavant
#
# **** A FAIRE DANS UNE PROCHAINE VERSION (a propos etape 3) ) ***
# le choix de reprendre le style est fait pour garder une coherence avec les fichiers .her produits par
# les versions anterieures de msh2her.pl.
# ca fait un peu doublon en terme de code. Il faudrait ecrire une sub
# qui centralise l operation d ecriture du maillage. Elle serait appelee une fois apres la lecture du .msh
# et une seconde fois dans la sub suppr_noeuds_non_references()
# **Probleme a gerer : actuellement la structure des variables est tres differente
# entre celles utilises lors la lecture du .msh (@les_noeuds, @type_herezh_element, etc...)
# et celles fournies en sortie de la sub lecture_mail_her()
#
sub suppr_noeuds_non_references {
my $fher = shift;
my $nom_maillage = shift;
my $nb_noeuds = shift;
my $ref_noeuds = shift;
my $nb_elts = shift;
my $ref_elements = shift;
my $tmp_ref_listes = shift;
my @ref_listes = @$tmp_ref_listes;#on remet le dernier argument sous forme de liste

#liste des noeuds n appartenant a aucun element (noeuds non references)
my @ind_noeuds; for(my $i=1; $i<=$nb_noeuds; $i++) {$ind_noeuds[$i] = 0;}
for(my $i=1; $i<=$nb_elts; $i++) {foreach my $noeud (@{$ref_elements->{$i}{'CONNEX'}}) {$ind_noeuds[$noeud] = 1;}}
my @noeuds_non_ref;
for(my $i=1; $i<=$nb_noeuds; $i++) {push(@noeuds_non_ref,$i) if($ind_noeuds[$i] == 0);}
#suppression des noeuds non references et modif dans les listes de noeuds
for(my $i=1; $i<=$nb_noeuds; $i++) {
undef(@{$ref_noeuds->[$i]}) if(not $ind_noeuds[$i]);
}
#creation de la nouvelle table des noeuds
my @tab_noeuds_final; my $nb_noeuds_final = 0;
my @tab_corresp_ini_final;
for(my $i=1; $i<=$nb_noeuds; $i++) {
$tab_corresp_ini_final[$i] = 0;
next if(not defined($ref_noeuds->[$i][0]));
$nb_noeuds_final++;
@{$tab_noeuds_final[$nb_noeuds_final]} = @{$ref_noeuds->[$i]};
$tab_corresp_ini_final[$i] = $nb_noeuds_final;
}
#modif de la table des elements
for(my $i=1; $i<=$nb_elts; $i++) {
for(my $j=0; $j<=$#{$ref_elements->{$i}{'CONNEX'}}; $j++) {
$ref_elements->{$i}{'CONNEX'}[$j] = $tab_corresp_ini_final[$ref_elements->{$i}{'CONNEX'}[$j]];
}
}
#modif des listes de noeuds
my $noeud_old;
my @new_liste;
foreach my $nom_liste (keys(%{$ref_listes[0]})) {
undef(@new_liste);
for(my $i=0; $i<=$#{$ref_listes[0]->{$nom_liste}}; $i++) {
$noeud_old = $ref_listes[0]->{$nom_liste}[$i];
push(@new_liste,$tab_corresp_ini_final[$noeud_old]) if(defined($ref_noeuds->[$noeud_old][0]));
}
#si nouvelle liste non vide, on remplace
if(defined($new_liste[0])) {
@{$ref_listes[0]->{$nom_liste}} = @new_liste;
}
#sinon, on supprime la key de la table avec delete()
else {delete($ref_listes[0]->{$nom_liste});}
}#foreach my $nom_liste (keys(%{$ref_listes[0]}))
#saisie de l ordre des listes de references dans le fichier (pour les recopier dans le meme ordre que le fichier original)
# (on les classe par "level", c est-a-dire : "NOEUDS" => apres les noeuds dans le .her
# "ELEMENTS" => apres les elements dans le .her
my %ordre_listes;
my $level;

open(Fher, "<$fher");
while(<Fher>) {
if(/^\s*noeuds/) {$level = "NOEUDS";}
elsif(/^\s*elements/) {$level = "ELEMENTS";}
elsif(/^\s*(N\S+)/) {push(@{$ordre_listes{$level}},$1);}
elsif(/^\s*(A\S+)/) {push(@{$ordre_listes{$level}},$1);}
elsif(/^\s*(F\S+)/) {push(@{$ordre_listes{$level}},$1);}
elsif(/^\s*(E\S+)/) {push(@{$ordre_listes{$level}},$1);}
elsif(/^\s*(G\S+)/) {push(@{$ordre_listes{$level}},$1);}
}
close(Fher);

#reecriture du maillage (en reprenant la presentation du fichier
open(Fher, ">$fher");

print Fher ("\n");
print Fher ("\n" . '#############################################################################');
print Fher ("\n" . '# #');
print Fher ("\n" . '# msh2her.pl #');
print Fher ("\n" . '# transformation d\'un maillage genere par le programme gmsh #');
print Fher ("\n" . '# en un maillage utilisable par Herezh++ #');
print Fher ("\n" . '#############################################################################');
print Fher ("\n" . '# licence GPL, gerard.rio@univ-ubs.fr #');
print Fher ("\n" . '# http://www-lg2m.univ-ubs.fr/~rio #');
print Fher ("\n" . '# version '."$version".' #');
print Fher ("\n" . '#############################################################################');
print Fher ("\n\n\n");

#nom du maillage (eventuel)
print Fher "\n nom_maillage $nom_maillage\n\n" if(defined($nom_maillage));

#noeuds
print Fher "\n noeuds ------------";
print Fher "\n $nb_noeuds_final NOEUDS";
print Fher "\n\n\n";
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' #|NO DU| X | Y | Z |');
print Fher ("\n" . ' #|NOEUD| | | |');
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n");

for(my $i=1; $i<=$nb_noeuds_final; $i++) {
print Fher ("\n ". $i." ". $tab_noeuds_final[$i][0] ." ". $tab_noeuds_final[$i][1] ." ". $tab_noeuds_final[$i][2] );
}
print Fher "\n\n\n";

#listes de noeuds dans .her
print Fher "\n\n\n";
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' # references de noeuds |');
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n");
foreach my $nom_liste (@{$ordre_listes{'NOEUDS'}}) {
next if(not defined($ref_listes[0]->{$nom_liste}[0]));
ecrire_liste_N_E(*Fher, " ".$nom_liste, @{$ref_listes[0]->{$nom_liste}});
print Fher "\n";
}
print Fher "\n" if($#{$ordre_listes{'NOEUDS'}} != -1);

#elements
print Fher ("\n\n\n");
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' # les elements |');
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');

print Fher ("\n" . ' elements ------------');
print Fher "\n $nb_elts ELEMENTS";
print Fher "\n\n\n";
print Fher ("\n" . ' #----------------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' #| NO | | |');
print Fher ("\n" . ' #|ELTS | type element | Noeuds |');
print Fher ("\n" . ' #----------------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n");
for(my $i=1; $i<=$nb_elts; $i++) {
print Fher " $i $ref_elements->{$i}{'TYPE'} @{$ref_elements->{$i}{'CONNEX'}}\n";
}
print Fher "\n" if($#{$ordre_listes{'ELEMENTS'}} != -1);


#listes elements
print Fher ("\n\n\n");
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' # references elements |');
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n");

for(my $i=0; $i<=$#{$ordre_listes{'ELEMENTS'}}; $i++) {
# rq : $ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i] contient le nom de la liste

next if(not $ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i] =~ /^E/); # uniquement les listes d elements

next if(not defined($ref_listes[3]->{$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i]}[0]));
ecrire_liste_N_E(*Fher, "\n ".$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i], @{$ref_listes[3]->{$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i]}});
}

#listes d aretes
print Fher ("\n\n\n");
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' # references aretes elements |');
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n");

for(my $i=0; $i<=$#{$ordre_listes{'ELEMENTS'}}; $i++) {
# rq : $ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i] contient le nom de la liste

next if(not $ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i] =~ /^A/); # uniquement les listes d aretes

next if(not defined($ref_listes[1]->{$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i]}[0]));
ecrire_liste_A_F(*Fher, "\n ".$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i], @{$ref_listes[1]->{$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i]}});
}

#listes de faces
print Fher ("\n\n\n");
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n" . ' # references de faces elements |');
print Fher ("\n" . ' #---------------------------------------------------------------');
print Fher ("\n");

for(my $i=0; $i<=$#{$ordre_listes{'ELEMENTS'}}; $i++) {
# rq : $ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i] contient le nom de la liste

next if(not $ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i] =~ /^F/); # uniquement les listes de faces

next if(not defined($ref_listes[2]->{$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i]}[0]));
ecrire_liste_A_F(*Fher, "\n ".$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i], @{$ref_listes[2]->{$ordre_listes{'ELEMENTS'}[$i]}});
}


#
# NB : pour l instant, pas de listes de points d integration a ecrire dans msh2her.pl
# a modifier le jour ou il y en aura (elles sont deja dispos dans @ordre_listes{'ELEMENTS'} )
#

close(Fher);

}#sub suppr_noeuds_non_references


#----------------



#MODIF J. Troufflard
#----------------
#sub qui lit un maillage herezh++ pour recuperer les noeuds, les elements et les listes de references
#et les renvoier sous forme de reference (lecture du .her et d un .lis si il existe)
#
# exemple d appel :
# my ($nom_maillage, $nb_noeuds, $ref_tab_noeuds, $nb_elts, $ref_tab_elements, @ref_listes) = lecture_mail_her("fic_her");
#
# avec - $nom_maillage : nom du maillage (si il y en a un. sinon $nom_maillage sera egal a undef
# - $nb_noeuds : nombre de noeuds (entier)
# - $ref_tab_noeuds : reference vers un tableau de noeuds => $ref_tab_noeuds->[no noeud][0] : coordonnee x
# $ref_tab_noeuds->[no noeud][1] : coordonnee y
# $ref_tab_noeuds->[no noeud][2] : coordonnee z)
# - $nb_elts : nombre d elements (entier)
# - $ref_tab_elements : reference vers une table de hashage => $ref_tab_elements->{no elt}{'TYPE'} : type d element
# @{$ref_tab_elements->{no elt}{'CONNEX'}} : (liste des noeuds)
# - @ref_listes : liste de references vers les tables de hashage contenant les listes de references de noeuds, aretes, faces et elements
# => $ref_listes[0] : reference vers la table de hashage des listes de noeuds => @{$ref_listes[0]->{'nom liste'}} : (liste des noeuds)
# $ref_listes[1] : reference vers la table de hashage des listes d aretes => @{$ref_listes[1]->{'nom liste'}} : (liste des aretes)
# $ref_listes[2] : reference vers la table de hashage des listes de faces => @{$ref_listes[2]->{'nom liste'}} : (liste des faces)
# $ref_listes[3] : reference vers la table de hashage des listes d elements => @{$ref_listes[3]->{'nom liste'}} : (liste des elements)
# $ref_listes[4] : reference vers la table de hashage des listes de points d integration => @{$ref_listes[4]->{'nom liste'}} : (liste des points d integration)
#
sub lecture_mail_her {
my $fher = shift;

my $nom_maillage;

#------------------------
# lecture du maillage .her
#------------------------
#-lecture de noeuds
my @tab_noeuds; my $nb_noeuds;
my $no_noeud = 0;
open(Fher, "<$fher");
while(<Fher>) {
if(/^\s*nom_maillage\s+(\S+)/) {$nom_maillage = $1; next;}
next if(not /(\d+)\s+NOEUDS/);
$nb_noeuds = $1;
last;
}
while(<Fher>) {
last if($no_noeud == $nb_noeuds);
next if(not /^\s*(\d+)\s+(\S+)\s+(\S+)\s+(\S+)\s*$/);
$no_noeud = $1;
@{$tab_noeuds[$no_noeud]} = ($2,$3,$4);
}

#-lecture des elements
my %tab_elements; my $nb_elts;
my $no_elt = 0;
while(<Fher>) {
next if(not /(\d+)\s+ELEMENTS/);
$nb_elts = $1;
last;
}
while(<Fher>) {
last if($no_elt == $nb_elts);
next if(not /^\s*\d+\s+\w+\s+\w+/);
s/^\s+//;s/\s+$//;
$_ =~ /^(\d+)\s+/;
$no_elt = $1; s/^(\d+)\s+//;
$_ =~ /\s+(\d+(?:\s+\d+)*)$/;
@{$tab_elements{$no_elt}{'CONNEX'}} = split(/\s+/, $1); s/\s+(\d+(?:\s+\d+)*)$//;
$tab_elements{$no_elt}{'TYPE'} = $_; $tab_elements{$no_elt}{'TYPE'} =~ s/\s+/ /g;
}
close(Fher);


#------------------------
# lecture des references (dans le .her et dans un eventuel .lis)
#------------------------
my $flis = $fher; $flis =~ s/.her$/.lis/;
my $nom_liste;
my $is_liste_en_cours;
my %listes_NOEUDS;
my %listes_ARETES;
my %listes_FACES;
my %listes_ELEMENTS;
my %listes_PTI;

#-dans le .her
open(Fher, "<$fher");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Fher>) {
chomp;
if(/^\s*(N\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*N\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_NOEUDS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[AFEG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_NOEUDS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Fher);

open(Fher, "<$fher");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Fher>) {
chomp;
if(/^\s*(A\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*A\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ARETES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NFEG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ARETES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Fher);

open(Fher, "<$fher");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Fher>) {
chomp;
if(/^\s*(F\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*F\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_FACES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NAEG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_FACES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Fher);

open(Fher, "<$fher");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Fher>) {
chomp;
if(/^\s*(E\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*E\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ELEMENTS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NAFG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ELEMENTS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Fher);

open(Fher, "<$fher");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Fher>) {
chomp;
if(/^\s*(G\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*G\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_PTI{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NAFE]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_PTI{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Fher);


#dans le .lis (si il existe)
if(-e $flis) {

open(Flis, "<$flis");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Flis>) {
chomp;
if(/^\s*(N\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*N\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_NOEUDS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[AFEG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_NOEUDS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Flis);

open(Flis, "<$flis");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Flis>) {
chomp;
if(/^\s*(A\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*A\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ARETES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NFEG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ARETES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Flis);

open(Flis, "<$flis");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Flis>) {
chomp;
if(/^\s*(F\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*F\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_FACES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NAEG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_FACES{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Flis);

open(Flis, "<$flis");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Flis>) {
chomp;
if(/^\s*(E\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*E\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ELEMENTS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NAFG]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_ELEMENTS{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Flis);

open(Flis, "<$flis");
$is_liste_en_cours = 0;
while(<Flis>) {
chomp;
if(/^\s*(G\S+)/) {
$nom_liste = $1;
$is_liste_en_cours = 1;
s/^\s*G\S+\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_PTI{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
elsif(/^\s*noeuds/i or /^\s*elements/i or /^\s*[NAFE]/) {
$is_liste_en_cours = 0;
}
elsif($is_liste_en_cours and /^\s*\d+(\s+\d+)*\s*$/i) {
s/^\s+//; s/\s+$//;
push(@{$listes_PTI{$nom_liste}},split(/\s+/,$_));
}
}
close(Flis);

}#if(-e $flis)

#AFFICHAGE DES LISTES DE NOEUDS
#foreach my $nom (keys(%listes_NOEUDS)) {
# print "$nom : @{$listes_NOEUDS{$nom}}\n";
#}
#AFFICHAGE DES LISTES D ARETES
#foreach my $nom (keys(%listes_ARETES)) {
# print "$nom : @{$listes_ARETES{$nom}}\n";
#}
#AFFICHAGE DES LISTES DE FACES
#foreach my $nom (keys(%listes_FACES)) {
# print "$nom : @{$listes_FACES{$nom}}\n";
#}
#AFFICHAGE DES LISTES D ELEMENTS
#foreach my $nom (keys(%listes_ELEMENTS)) {
# print "$nom : @{$listes_ELEMENTS{$nom}}\n";
#}
#AFFICHAGE DES LISTES DE POINTS D INTEGRATION
#foreach my $nom (keys(%listes_PTI)) {
# print "$nom : @{$listes_PTI{$nom}}\n";
#}

return($nom_maillage, $nb_noeuds, \@tab_noeuds, $nb_elts, \%tab_elements,
\%listes_NOEUDS, \%listes_ARETES,
\%listes_FACES, \%listes_ELEMENTS, \%listes_PTI);
}#sub lecture_mail_her


#MODIF J. Troufflard
#----------------
#sub pour ecrire une liste de noeuds et elements (on indique un handle de fichier deja ouvert)
sub ecrire_liste_N_E {
my $handle = shift;
my $nom_liste = shift;
my @liste_no = @_;

my $cpt; my $cpt_max = 15; my $nb_blancs;

$nb_blancs = ""; $nb_blancs .= " " for(1 .. length($nom_liste));
$_ = shift(@liste_no);
print $handle "$nom_liste $_";
$cpt = 1;
foreach my $no (@liste_no) {
$cpt++;
if($cpt == 1) {print $handle "$nb_blancs $no";}
elsif($cpt == $cpt_max) {print $handle " $no\n"; $cpt = 0;}
else {print $handle " $no";}
}
print $handle "\n" if($cpt != $cpt_max);
}#sub ecrire_liste_noeuds


#MODIF J. Troufflard
#----------------
#sub pour ecrire une liste d aretes et faces (on indique un handle de fichier deja ouvert)
sub ecrire_liste_A_F {
my $handle = shift;
my $nom_liste = shift;
my @liste_no = @_;

my $cpt; my $cpt_max = 30; my $nb_blancs;

$nb_blancs = ""; $nb_blancs .= " " for(1 .. length($nom_liste));
$_ = shift(@liste_no);
print $handle "$nom_liste $_";
$cpt = 1;
foreach my $no (@liste_no) {
$cpt++;
if($cpt == 1) {print $handle "$nb_blancs $no";}
elsif($cpt == $cpt_max) {print $handle " $no\n"; $cpt = 0;}
else {print $handle " $no";}
}
print $handle "\n" if($cpt != $cpt_max);
}#sub ecrire_liste_A_F
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